254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0037 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0037  tRNA-Gln  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0046  tRNA-Gln  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255383  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0028  tRNA-Gln  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  94.74 
 
 
75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  94.74 
 
 
75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0048  tRNA-Gln  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000709091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0028  tRNA-Gln  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127569  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  88.16 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0051  tRNA-Gln  93.48 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000244153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0012  tRNA-Gln  93.48 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  95.12 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  95.12 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  95.12 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0015  tRNA-Gln  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060017  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna0  tRNA-Gln  95 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00008  tRNA-Gln  94.87 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000112561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00009  tRNA-Gln  94.87 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000116069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0074  tRNA-Gln  88.06 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0066  tRNA-Gln  94.87 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.69731e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0758  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000782067  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0030  tRNA-Gln  94.87 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000433047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0826  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000524699  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0733  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000545743  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0779  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000652384  normal  0.543785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0718  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136719  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0780  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000640046  normal  0.628389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0066  tRNA-Gln  94.87 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0358271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  88.06 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  88.06 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0827  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000850909  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0792  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00549034  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0791  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0431042  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0732  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000561331  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0687  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000017545  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0581  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000459899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0580  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000400154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0686  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000180239  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0074  tRNA-Gln  88.06 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4649  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000820589  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4648  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000366514  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0719  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000164709  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0079  tRNA-Gln  94.87 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237072  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5014  tRNA-Gln  94.87 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0757  tRNA-Gln  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000702107  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0080  tRNA-Gln  94.87 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246574  normal 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  91.3 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  91.3 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00709266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0035  tRNA-Gln  90 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000188395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0017  tRNA-Gln  91.3 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000337477  normal  0.142924 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2765  tRNA-Gln  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.114736  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0046  tRNA-Gln  91.3 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.814409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0037  tRNA-Gln  87.01 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0041  tRNA-Gln  89.47 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0039  tRNA-Gln  91.11 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00156517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0009  tRNA-Gln  91.11 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.001106  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0041  tRNA-Gln  89.47 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.794543  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0078  tRNA-Gln  94.44 
 
 
74 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33097  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  85.53 
 
 
75 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0035  tRNA-Gln  92.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014299  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0050  tRNA-Gln  92.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000011016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0038  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000497098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5727  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5661  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.57 
 
 
78 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.57 
 
 
78 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  86.57 
 
 
78 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000184976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  86.57 
 
 
78 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  86.57 
 
 
78 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.57 
 
 
78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.57 
 
 
78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  86.57 
 
 
78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0172  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0373789 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000106014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0274  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2518  tRNA-Gln  92.31 
 
 
75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0017354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  92.31 
 
 
75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  92.31 
 
 
75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  92.31 
 
 
75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  92.31 
 
 
75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  92.31 
 
 
75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0042  tRNA-Gln  92.31 
 
 
72 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000017431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5717  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00280638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0047  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000522107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4766  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0611  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000107562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0296  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000266549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5047  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000895408  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0855  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000488484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5655  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0099  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  86.57 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>