222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0048 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0048  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000709091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0046  tRNA-Gln  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0042  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000017431  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0028  tRNA-Gln  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0037  tRNA-Gln  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0057  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00709266  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0036  tRNA-Gln  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0017  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000337477  normal  0.142924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0028  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0039  tRNA-Gln  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00156517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0046  tRNA-Gln  87.01 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0289454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00008  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000112561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00009  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000116069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0066  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.69731e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0758  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000782067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0826  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000524699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0581  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000459899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4648  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000366514  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0718  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136719  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0779  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000652384  normal  0.543785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0757  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000702107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0827  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000850909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0686  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000180239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0079  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237072  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt09  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt09  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0041  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000496114  hitchhiker  0.0000000000277547 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0732  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000561331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0719  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000164709  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0033  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000000894061  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0733  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000545743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0780  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000640046  normal  0.628389 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0328  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000157113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4260  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.09084e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4649  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000820589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0687  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000017545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0030  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000433047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0012  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5014  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0029  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000654097  hitchhiker  0.000794999 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0066  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0358271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0080  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0051  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000244153  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0792  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00549034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0791  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0431042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0035  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014299  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0059  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna0  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000260011  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000561751  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000537672  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0050  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000011016  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000150139  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000169355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0004  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2234  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0580  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000400154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2518  tRNA-Gln  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0017354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0007  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.102252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t1806  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000098323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2564  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0093  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0638  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1386  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0035  tRNA-Gln  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000188395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0008  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0004  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0063  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.51209e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0782  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000722917  normal  0.446267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0722  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000907062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0736  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000556049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5017  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158561  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0830  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000784737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0783  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000582426  normal  0.4419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0721  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0464  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.99671e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0578  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.87866e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0046  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.814409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5016  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0046  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000171717  normal  0.0156007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0033  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706309  hitchhiker  0.000775918 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0735  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000520956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0795  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000207498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>