220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_R0042 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_R0042  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000017431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0296  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000266549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0536  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34797e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0193  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000238459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5669  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5727  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5652  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000646012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5661  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0099  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000184976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000198835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0951866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.75916e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5143  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000037642  normal  0.817541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0172  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0373789 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000106014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0855  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000488484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5655  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0611  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000107562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0274  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4766  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0780  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63949e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5717  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00280638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0089  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5047  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4576  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0809637 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0038  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000497098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0047  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000522107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0038  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.218666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0046  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000115177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0088  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000264747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0032  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0041  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0074  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0041  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.794543  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0074  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0048  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000709091  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2518  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0017354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0095  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224938  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt012  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00741063  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0406  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.426479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0107  tRNA-Gln  87.88 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0057  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000150139  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000169355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0058  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t1806  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000098323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2564  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0093  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0638  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1386  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3147t  tRNA-Gln  87.3 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000099101  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3152t  tRNA-Gln  87.3 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000938948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0046  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3145t  tRNA-Gln  87.3 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3143t  tRNA-Gln  87.3 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000544986  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0721  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00011  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000114888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0063  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.51209e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0064  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.7933e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0783  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000582426  normal  0.4419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0690  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0578  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.87866e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0464  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.99671e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0689  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0782  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000722917  normal  0.446267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0722  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000907062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0076  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0032  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666816  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0033  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706309  hitchhiker  0.000775918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0760  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000001352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>