115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0406 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mflt012  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00741063  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0406  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.426479  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 72 bp  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5652  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000646012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5661  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000184976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000198835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0951866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.75916e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000106014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0038  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000497098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0047  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000522107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0089  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0099  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0193  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000238459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0296  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000266549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0611  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000107562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0855  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000488484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5655  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5669  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5717  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00280638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5727  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4576  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0809637 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4766  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5047  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5143  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000037642  normal  0.817541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0172  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0373789 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0274  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0536  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34797e-32 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0780  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63949e-30 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000150139  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 72 bp  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000169355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 72 bp  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 72 bp  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0032  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t1806  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 72 bp  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000098323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2564  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 72 bp  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0093  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 72 bp  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0638  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1386  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 72 bp  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0038  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.218666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0046  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000115177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0088  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 72 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000264747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0095  tRNA-Gln  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0107  tRNA-Gln  92.42 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2518  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0017354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0041  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0074  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0041  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.794543  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0074  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0058  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0016  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0053  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000068806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0042  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000017431  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0052  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1592  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000946426  normal  0.766163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0058  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0073  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0767991 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0019  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0014  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0016  tRNA-Gln  86.79 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0057  tRNA-Gln  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0028  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1538  tRNA-Gln  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1545  tRNA-Gln  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.87406e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>