73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0020 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_R0020  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0017  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188037  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0035  tRNA-Gln  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000188395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0050  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000011016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0035  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014299  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2518  tRNA-Gln  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0017354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0007  tRNA-Gln  88.16 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000424664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0004  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000420183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0193  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000238459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0296  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000266549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0611  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000107562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0855  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000488484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5655  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5669  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0031  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0030  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4258  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.53905e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0099  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5717  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00280638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5727  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4576  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0809637 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4766  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5047  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5143  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000037642  normal  0.817541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0172  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0373789 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0274  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0536  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34797e-32 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0780  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63949e-30 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0038  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.218666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0046  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000115177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0095  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0032  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.75916e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0951866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000198835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000184976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5661  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5652  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000646012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0089  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000106014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0038  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000497098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0047  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000522107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4257  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.43895e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0330  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000145086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0017  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000220842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>