18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0935 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0935  Mur ligase middle domain protein  100 
 
 		 405 aa  834    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0066  capsule biosynthesis protein Capb  56.53 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2107  capB protein  47.26 
 
 		 385 aa  363  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0305  Mur ligase middle domain protein  40.84 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0034  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1548 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3044  Mur ligase family CapB protein  27.65 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3663  hypothetical protein  25.47 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1737  hypothetical protein  24.38 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2212  Mur ligase middle domain protein  26.03 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1277  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  28.5 
 
 		 466 aa  47  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396011  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3396  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  28.75 
 
 		 470 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4050  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  30.19 
 
 		 469 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1845  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.21 
 
 		 537 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0734  folylpolyglutamate synthase  27.27 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00291399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2192  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  27.53 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1992  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  28.3 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00736654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6176  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  28.57 
 
 		 466 aa  43.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1685  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  23.77 
 
 		 460 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.500264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>