10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0305 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0305  Mur ligase middle domain protein  100 
 
 
396 aa  791    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0066  capsule biosynthesis protein Capb  37.24 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0935  Mur ligase middle domain protein  40.84 
 
 
405 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2107  capB protein  36.51 
 
 
385 aa  229  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0034  hypothetical protein  27.88 
 
 
1548 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3663  hypothetical protein  31.22 
 
 
526 aa  83.6  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3044  Mur ligase family CapB protein  31.49 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1737  hypothetical protein  28.17 
 
 
334 aa  63.5  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2212  Mur ligase middle domain protein  30.46 
 
 
447 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2925  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  26.29 
 
 
471 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000583962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>