13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3044 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3044  Mur ligase family CapB protein  100 
 
 
394 aa  797    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2212  Mur ligase middle domain protein  47.28 
 
 
447 aa  303  5.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3663  hypothetical protein  43.82 
 
 
526 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0305  Mur ligase middle domain protein  31.49 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2107  capB protein  24.75 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0935  Mur ligase middle domain protein  28.89 
 
 
405 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0066  capsule biosynthesis protein Capb  25 
 
 
464 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1737  hypothetical protein  28.11 
 
 
334 aa  56.6  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0034  hypothetical protein  23.65 
 
 
1548 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  28.16 
 
 
432 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  28.57 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  25.38 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2502  FolC bifunctional protein  31.11 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>