25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3663 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3663  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1087    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2212  Mur ligase middle domain protein  43.35 
 
 		 447 aa  295  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3044  Mur ligase family CapB protein  43.82 
 
 		 394 aa  289  9e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0305  Mur ligase middle domain protein  31.22 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0066  capsule biosynthesis protein Capb  27.61 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2107  capB protein  23.9 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0935  Mur ligase middle domain protein  25.47 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0034  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1548 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1737  hypothetical protein  24.91 
 
 		 334 aa  51.2  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01207  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  27.98 
 
 		 443 aa  50.4  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  32.32 
 
 		 433 aa  47.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  25.56 
 
 		 429 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  26.17 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  27.53 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  25.77 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  29.27 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  28.57 
 
 		 813 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  25.76 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  26.06 
 
 		 472 aa  44.3  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  27.96 
 
 		 840 aa  44.3  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1640  protein of unknown function DUF1508  28.1 
 
 		 956 aa  43.9  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  26.88 
 
 		 428 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  22.22 
 
 		 441 aa  43.9  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  21.51 
 
 		 441 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.82 
 
 		 466 aa  43.5  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>