9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2107 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2107  capB protein  100 
 
 		 385 aa  793    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0066  capsule biosynthesis protein Capb  49.22 
 
 		 464 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0935  Mur ligase middle domain protein  47.26 
 
 		 405 aa  351  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0305  Mur ligase middle domain protein  36.51 
 
 		 396 aa  229  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0034  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1548 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3044  Mur ligase family CapB protein  24.75 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3663  hypothetical protein  23.75 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2212  Mur ligase middle domain protein  30.71 
 
 		 447 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1737  hypothetical protein  23.53 
 
 		 334 aa  43.1  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>