11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2212 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2212  Mur ligase middle domain protein  100 
 
 
447 aa  915    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3044  Mur ligase family CapB protein  47.28 
 
 
394 aa  317  4e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3663  hypothetical protein  43.35 
 
 
526 aa  310  5e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0066  capsule biosynthesis protein Capb  30.07 
 
 
464 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0305  Mur ligase middle domain protein  30.46 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2107  capB protein  29.73 
 
 
385 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1737  hypothetical protein  25.18 
 
 
334 aa  57.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0935  Mur ligase middle domain protein  29.26 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1535  folylpolyglutamate synthetase  35.71 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  26.94 
 
 
418 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  39.19 
 
 
453 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>