111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2555 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2555  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  226  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2556  hypothetical protein  72.92 
 
 
105 aa  136  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.51201  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0091  hypothetical protein  70.97 
 
 
114 aa  110  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0295  hypothetical protein  60.98 
 
 
94 aa  97.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0130  protein of unknown function DUF156  59.26 
 
 
96 aa  94.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0324  hypothetical protein  57.95 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  52.38 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0438  protein of unknown function DUF156  33.65 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0714  hypothetical protein  37.8 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00303881  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1552  protein of unknown function DUF156  44 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.05294  normal  0.0149164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3411  protein of unknown function DUF156  32.22 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0125991 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0131  hypothetical protein  36.14 
 
 
90 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  36.14 
 
 
92 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  37.8 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11230  hypothetical protein  36.56 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.499044 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  32.53 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  32.14 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1271  protein of unknown function DUF156  37.31 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.858801  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  32.53 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0195  hypothetical protein  32.5 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165888  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0391  hypothetical protein  38.75 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01250  hypothetical protein  36 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  36.49 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0193  hypothetical protein  32.5 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00253275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2303  protein of unknown function DUF156  38.67 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  40 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  32.5 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2350  protein of unknown function DUF156  37.84 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0979589  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  32.22 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  34.09 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  34.57 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1838  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  37.97 
 
 
89 aa  47.4  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1741  protein of unknown function DUF156  36.47 
 
 
92 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  43.48 
 
 
98 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  28.16 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  42.62 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0988  protein of unknown function DUF156  30.38 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.11096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2861  hypothetical protein  36.49 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  39.73 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06025  hypothetical protein  39.68 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0101  protein of unknown function DUF156  34.48 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  39.24 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  32.91 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  32.91 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  37.93 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  36.71 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2226  hypothetical protein  38.96 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  38.24 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  36.9 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0465  hypothetical protein  35.14 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  36.36 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  32 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2130  hypothetical protein  30.16 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3691  hypothetical protein  32.95 
 
 
135 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.32018  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  32.43 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  39.22 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  31.58 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3352  hypothetical protein  35.14 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  39.22 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2087  hypothetical protein  38.75 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.0236957 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  34.12 
 
 
91 aa  42  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  28.74 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  41.18 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  34.15 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  34.15 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  32.93 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0617  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  28.57 
 
 
91 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  40.54 
 
 
145 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0538  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0774012  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1421  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0973225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3728  protein of unknown function DUF156  29.33 
 
 
111 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00718584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  35.37 
 
 
123 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0212  protein of unknown function DUF156  31.33 
 
 
103 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.050462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  41.18 
 
 
88 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  30 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  30 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  34.25 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  40.74 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3147  hypothetical protein  31.33 
 
 
103 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  28.89 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3676  protein of unknown function DUF156  29.27 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0410766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  39.22 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  32.43 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  35 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1887  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31313  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2304  hypothetical protein  30.95 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>