82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2304 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2304  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  167  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  37.97 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0391  hypothetical protein  36.47 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0212  protein of unknown function DUF156  38.27 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.050462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  30.95 
 
 
101 aa  50.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3411  protein of unknown function DUF156  29.35 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0125991 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  31.71 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  30.95 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  30.95 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  30.95 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  30.95 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  30.95 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  30.95 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  30.95 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  30.95 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  36.25 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  33.71 
 
 
95 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  42.86 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  38.98 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0324  hypothetical protein  36.67 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  29.76 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  29.76 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  36.14 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  32.61 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  34.94 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3147  hypothetical protein  35.29 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  34.94 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  32.14 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  32 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  30.77 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  38.03 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  36.07 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  32.61 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  36.05 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  31.03 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  38.1 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  29.27 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  29.27 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  30.68 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  32.61 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
97 aa  42  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  32.93 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  34.94 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  35.21 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  38.03 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  31.82 
 
 
87 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  28.57 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  28.57 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0130  protein of unknown function DUF156  32.91 
 
 
96 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  28.57 
 
 
91 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  38.1 
 
 
103 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  28.74 
 
 
110 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  31.33 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  26.83 
 
 
103 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  35.63 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  31.03 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  32.94 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  31.03 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0918  protein of unknown function DUF156  28.41 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  28.74 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  29.55 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  32.58 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  34.15 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  37.14 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2921  hypothetical protein  35.63 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2555  hypothetical protein  30.95 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2635  protein of unknown function DUF156  38.6 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  29.55 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  35.21 
 
 
86 aa  40.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  30.86 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  42 
 
 
91 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  40.35 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  31.33 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  32.18 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3295  hypothetical protein  40.79 
 
 
94 aa  40  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484311  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1898  hypothetical protein  31.48 
 
 
90 aa  40  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2187  hypothetical protein  31.48 
 
 
90 aa  40  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  35.85 
 
 
98 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>