107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2556 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2556  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  213  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.51201  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2555  hypothetical protein  72.92 
 
 
112 aa  136  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0091  hypothetical protein  78.89 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0130  protein of unknown function DUF156  58.24 
 
 
96 aa  97.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0295  hypothetical protein  59.34 
 
 
94 aa  97.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0324  hypothetical protein  53.41 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  46.34 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3411  protein of unknown function DUF156  37.97 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0125991 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  38.55 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  33.33 
 
 
103 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1552  protein of unknown function DUF156  42.67 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.05294  normal  0.0149164 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01250  hypothetical protein  36.84 
 
 
114 aa  52  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  35.16 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0438  protein of unknown function DUF156  37.21 
 
 
107 aa  50.8  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11230  hypothetical protein  38.14 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.499044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  41.1 
 
 
99 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0391  hypothetical protein  34.44 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1271  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.858801  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  35.14 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  35.23 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  32.14 
 
 
91 aa  48.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  44.29 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0101  protein of unknown function DUF156  35.53 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  40.28 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  44.29 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  34.07 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0131  hypothetical protein  36.14 
 
 
90 aa  47.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  33.75 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  36.84 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  32.14 
 
 
91 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  42.65 
 
 
98 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1838  protein of unknown function DUF156  38.67 
 
 
91 aa  47  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  33.75 
 
 
100 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  28.89 
 
 
91 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  33.75 
 
 
100 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  38.67 
 
 
95 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  33.75 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  33.75 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  33.75 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  33.75 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  33.75 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  33.75 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  33.75 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1741  protein of unknown function DUF156  36 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  36.36 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  35.06 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  32.22 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  32.5 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  32.5 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  33.78 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  35.62 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  29.76 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  35.53 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2350  protein of unknown function DUF156  38.24 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0979589  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2303  protein of unknown function DUF156  36 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1694  hypothetical protein  32.5 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.607073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0195  hypothetical protein  33.75 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165888  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  35.62 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1421  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0973225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  35.53 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  30.12 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0714  hypothetical protein  34.57 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00303881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  34.15 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  35.42 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2861  hypothetical protein  36.76 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06025  hypothetical protein  28.75 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  36.59 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  40 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0465  hypothetical protein  39.44 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  38.16 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0193  hypothetical protein  31.71 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00253275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  36.36 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0617  hypothetical protein  44.44 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  43.33 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  27.78 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0538  hypothetical protein  44.44 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0774012  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  32.94 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3243  hypothetical protein  34.72 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  31.08 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  40.7 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  32.95 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  37.68 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  43.14 
 
 
95 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  27.06 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0212  protein of unknown function DUF156  31.33 
 
 
103 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.050462  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  30.67 
 
 
91 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1531  hypothetical protein  42.62 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  27.38 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  41.18 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0017  hypothetical protein  36 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  40.91 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  26.67 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  32.39 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  39.34 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  38.24 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>