More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1215 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  47.46 
 
 
812 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.21 
 
 
866 aa  635    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  45.84 
 
 
835 aa  641    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  47.04 
 
 
814 aa  681    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  45.3 
 
 
817 aa  637    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  47.93 
 
 
812 aa  667    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  45.99 
 
 
830 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  46.67 
 
 
810 aa  659    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  47.85 
 
 
821 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  46.98 
 
 
823 aa  658    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  47.5 
 
 
822 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1857  ATPase AAA-2 domain-containing protein  75.1 
 
 
736 aa  1081    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  47.42 
 
 
829 aa  665    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2175  ATPase AAA-2 domain protein  74.69 
 
 
734 aa  1098    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  45.89 
 
 
818 aa  657    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  47.29 
 
 
824 aa  653    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  46.51 
 
 
820 aa  639    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  45.38 
 
 
854 aa  641    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  45.3 
 
 
834 aa  645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  46.31 
 
 
850 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  46.01 
 
 
812 aa  656    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  47.41 
 
 
816 aa  658    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  47.61 
 
 
825 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2016  ATPase  46.05 
 
 
847 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.551696  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  45.58 
 
 
852 aa  638    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1215  ATPase AAA-2  100 
 
 
745 aa  1481    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.26659  normal  0.784865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  47.18 
 
 
824 aa  658    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  45.61 
 
 
810 aa  643    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  45.74 
 
 
837 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  45.58 
 
 
834 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  47.59 
 
 
825 aa  668    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  46.28 
 
 
846 aa  640    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  45.55 
 
 
852 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  45.1 
 
 
841 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  47.5 
 
 
822 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  45.54 
 
 
848 aa  637    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  45.43 
 
 
830 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  47.96 
 
 
811 aa  669    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  47.24 
 
 
839 aa  666    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  48.54 
 
 
810 aa  671    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.98 
 
 
858 aa  639    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  47.86 
 
 
812 aa  657    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  46.61 
 
 
834 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  45.43 
 
 
844 aa  632  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.01 
 
 
862 aa  632  1e-180  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  46.01 
 
 
814 aa  632  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  45.83 
 
 
834 aa  635  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  45.45 
 
 
834 aa  632  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1731  ATPase  46.12 
 
 
845 aa  634  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  45.35 
 
 
836 aa  634  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  44.25 
 
 
840 aa  632  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.29 
 
 
851 aa  633  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  45.43 
 
 
847 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  45.43 
 
 
836 aa  633  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  44.81 
 
 
847 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  45.47 
 
 
811 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  45.06 
 
 
830 aa  629  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  46.18 
 
 
811 aa  631  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  45.44 
 
 
843 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  45.31 
 
 
844 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.71 
 
 
811 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  44.82 
 
 
869 aa  629  1e-179  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  45 
 
 
861 aa  631  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  44.97 
 
 
842 aa  629  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.47 
 
 
811 aa  627  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.47 
 
 
811 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  45.47 
 
 
811 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  45.42 
 
 
813 aa  627  1e-178  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.47 
 
 
811 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  45.18 
 
 
847 aa  626  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.47 
 
 
811 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  45.34 
 
 
811 aa  627  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.47 
 
 
811 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  44.65 
 
 
855 aa  626  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  46.21 
 
 
828 aa  626  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  45.36 
 
 
868 aa  625  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.47 
 
 
811 aa  627  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  43.76 
 
 
824 aa  624  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  45.03 
 
 
818 aa  623  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  44.54 
 
 
851 aa  623  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  44.72 
 
 
858 aa  624  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  45.03 
 
 
818 aa  623  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  45.06 
 
 
847 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  44.38 
 
 
825 aa  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  45.06 
 
 
847 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  45.81 
 
 
846 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  45.04 
 
 
814 aa  620  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  45.31 
 
 
848 aa  619  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  44.44 
 
 
823 aa  620  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  44.95 
 
 
843 aa  618  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  44.95 
 
 
826 aa  618  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45 
 
 
851 aa  618  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  45.05 
 
 
841 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  43.36 
 
 
829 aa  617  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  43.58 
 
 
822 aa  612  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  45.02 
 
 
815 aa  613  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  45.83 
 
 
819 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0023  ATPase AAA-2 domain protein  45.68 
 
 
789 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.95 
 
 
879 aa  613  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0025  ATPase AAA-2 domain protein  45.55 
 
 
789 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>