29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0108 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0108  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  296  6e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  28.81 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  31.09 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  29.23 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  30.11 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  32.22 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  33.91 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3075  putative lipoprotein  32.08 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000475601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3216  putative lipoprotein  32.08 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  31.11 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3035  hypothetical protein  32.08 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  27.47 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  31.11 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  31.11 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2630  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  28.16 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3156  conserved hypothetical protein  25.78 
 
 		 190 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0489  putative lipoprotein  25.78 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  32.5 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00405  predicted outer membrane lipoprotein  25.78 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00409  hypothetical protein  25.78 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0530  putative lipoprotein  25.78 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3162  glycoprotein/polysaccharide metabolism  25.78 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0497  putative lipoprotein  25.78 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  32.91 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.23 
 
 		 267 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0543  putative lipoprotein  25.78 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0547  hypothetical protein  30.95 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>