16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0547 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0547  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  317  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0512  hypothetical protein  98.73 
 
 		 194 aa  313  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0558  hypothetical protein  93.33 
 
 		 150 aa  237  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0565  hypothetical protein  82.67 
 
 		 150 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5021  hypothetical protein  66.67 
 
 		 154 aa  168  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4464  putative lipoprotein  61.74 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0688  lipoprotein, putative  72.9 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11370  putative lipoprotein  51.57 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0255476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1043  putative lipoprotein  56.25 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06690  hypothetical protein  47.37 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3859  hypothetical protein  46.94 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  31.15 
 
 		 132 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  29.51 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  28.69 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  28.69 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0108  hypothetical protein  30.95 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>