More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4929 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4929  dephospho-CoA kinase  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6325  dephospho-CoA kinase  52.79 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2441  dephospho-CoA kinase  45.16 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.527933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09488  putative dephospho-CoA kinase  38.04 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1427  dephospho-CoA kinase  35.11 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.355175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1405  dephospho-CoA kinase  35.56 
 
 		 198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0289966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  37.57 
 
 		 208 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  34.36 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6250  dephospho-CoA kinase  34.66 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1460  dephospho-CoA kinase  34.92 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1222  dephospho-CoA kinase  34.67 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.603789 
 
 
-
 
NC_002950  PG0483  kinase, putative  37.17 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0965  dephospho-CoA kinase  33.68 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.699237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  33.67 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  29.53 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1193  dephospho-CoA kinase  37.57 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.53954  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  30.57 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  31.09 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  30.05 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  30.05 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  30.05 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  30.61 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0985  dephospho-CoA kinase  34.41 
 
 		 211 aa  98.2  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0795  dephospho-CoA kinase  29.74 
 
 		 207 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  30.61 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  33.84 
 
 		 198 aa  95.1  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  29.02 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  31.32 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1100  dephospho-CoA kinase  36.97 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0558851  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0923  dephospho-CoA kinase  29.53 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  31.46 
 
 		 198 aa  92  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2187  dephospho-CoA kinase  30.96 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.724848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.85 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  28.57 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4450  dephospho-CoA kinase  31.98 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256936  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1537  dephospho-CoA kinase  31.16 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.121695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  29.44 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0148  dephospho-CoA kinase  32.99 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3196  dephospho-CoA kinase  32.4 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2226  dephospho-CoA kinase  27.32 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000129832  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  32.98 
 
 		 216 aa  88.2  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  34.21 
 
 		 201 aa  88.2  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1561  dephospho-CoA kinase  30 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  27.14 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  27.14 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  31.77 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  30.93 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2106  dephospho-CoA kinase  32.65 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0459  dephospho-CoA kinase  29.74 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  30.53 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  28.93 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  28.93 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  28.93 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  29.61 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  28.87 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1423  dephospho-CoA kinase  30 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  30 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  31.03 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11180  dephospho-CoA kinase  30.68 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  27.78 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  31.22 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  29.61 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3269  dephospho-CoA kinase  28.49 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000097205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2074  dephospho-CoA kinase  31.32 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000294948  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11647  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  31.28 
 
 		 407 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.644791 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  30.73 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1159  dephospho-CoA kinase  34.08 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00128248  normal  0.117716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  28.12 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  29.61 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2028  dephospho-CoA kinase  32.65 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214946  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1323  dephospho-CoA kinase  28.72 
 
 		 198 aa  84.7  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.018005  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0061  dephospho-CoA kinase  31.98 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000202187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  30.53 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  29.32 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  28.43 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1134  dephospho-CoA kinase  30.68 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  28.8 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2981  dephospho-CoA kinase  31.12 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261477  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1809  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  29.86 
 
 		 404 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000846791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  28.49 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  28.89 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  26.4 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  29.05 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2802  dephospho-CoA kinase  33.15 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1232  dephospho-CoA kinase  29.41 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.139689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  29.47 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  28.5 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  27.92 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  26.4 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1105  dephospho-CoA kinase  28.98 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.323015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  26.4 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  28.12 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04889  dephospho-CoA kinase  30.11 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  26.67 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  30.89 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25920  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  29.19 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  26.9 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  29.35 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  28.12 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>