More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6250 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6250  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
198 aa  408  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  45.31 
 
 
198 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1405  dephospho-CoA kinase  51.55 
 
 
198 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0289966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1427  dephospho-CoA kinase  42.49 
 
 
194 aa  167  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.355175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2441  dephospho-CoA kinase  47.42 
 
 
198 aa  148  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.527933  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  40.59 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09488  putative dephospho-CoA kinase  37.11 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6325  dephospho-CoA kinase  36.87 
 
 
203 aa  134  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1193  dephospho-CoA kinase  38.89 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.53954  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0985  dephospho-CoA kinase  37.44 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0244  dephospho-CoA kinase  36.04 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  38 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1954  dephospho-CoA kinase  36.04 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4929  dephospho-CoA kinase  34.66 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  38 
 
 
200 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  33.14 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  37.31 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  36.41 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  34.54 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  36.72 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  34.02 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1100  dephospho-CoA kinase  37.43 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0558851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  34.02 
 
 
205 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  36 
 
 
200 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  32.99 
 
 
205 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  34.02 
 
 
205 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
205 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  34.67 
 
 
202 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  35.39 
 
 
198 aa  106  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4423  dephospho-CoA kinase  36.61 
 
 
207 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0459  dephospho-CoA kinase  34.1 
 
 
215 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0302  dephospho-CoA kinase  33.67 
 
 
201 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0965  dephospho-CoA kinase  34.16 
 
 
212 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.699237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0923  dephospho-CoA kinase  31.96 
 
 
207 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  32.99 
 
 
207 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
205 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1838  dephospho-CoA kinase  35.75 
 
 
212 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.329616  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  36.67 
 
 
207 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  35.2 
 
 
200 aa  104  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0795  dephospho-CoA kinase  31.44 
 
 
207 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  34.17 
 
 
202 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
203 aa  104  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1537  dephospho-CoA kinase  36.52 
 
 
215 aa  104  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.121695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2981  dephospho-CoA kinase  35.63 
 
 
196 aa  104  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  33.72 
 
 
207 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
205 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1479  dephospho-CoA kinase  37.08 
 
 
213 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174152  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  34.34 
 
 
202 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0657  dephospho-CoA kinase  36.67 
 
 
206 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00457221  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  31.91 
 
 
207 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  35.2 
 
 
200 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1561  dephospho-CoA kinase  34.3 
 
 
201 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  35.2 
 
 
200 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  35.2 
 
 
201 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1159  dephospho-CoA kinase  32.76 
 
 
198 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00128248  normal  0.117716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1423  dephospho-CoA kinase  33.72 
 
 
201 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  34.29 
 
 
200 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1460  dephospho-CoA kinase  34.08 
 
 
217 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  32.95 
 
 
216 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  34.29 
 
 
200 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  34.64 
 
 
200 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  34.48 
 
 
198 aa  102  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  34.46 
 
 
211 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  32.64 
 
 
206 aa  101  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  32.66 
 
 
200 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  32.64 
 
 
206 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  33.67 
 
 
202 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  32.99 
 
 
205 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  34.64 
 
 
200 aa  101  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  33.14 
 
 
207 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  33.14 
 
 
207 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  33.71 
 
 
200 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0157  dephospho-CoA kinase  31.79 
 
 
206 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  32.64 
 
 
206 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0885  dephospho-CoA kinase  35.23 
 
 
195 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  32.32 
 
 
202 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  31.96 
 
 
209 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  32.32 
 
 
202 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  32.99 
 
 
205 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  30.77 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  30.77 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1252  dephospho-CoA kinase  34.1 
 
 
203 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.324295  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  30.77 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  33.14 
 
 
200 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  32.42 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  30.77 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  30.77 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  34.3 
 
 
202 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  32.32 
 
 
202 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  30.77 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  30.77 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  30.77 
 
 
206 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0153  dephospho-CoA kinase  31.79 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  30.41 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0154  dephospho-CoA kinase  31.79 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00343706  normal  0.0126579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0160  dephospho-CoA kinase  31.79 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3179  dephospho-CoA kinase  34.52 
 
 
203 aa  99  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  30.77 
 
 
206 aa  99  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  32.77 
 
 
211 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2943  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  33.87 
 
 
319 aa  99  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.492421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>