15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2920 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2920  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  431  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000251887  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4540  hypothetical protein  40.98 
 
 
177 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1346  hypothetical protein  30.16 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1743  hypothetical protein  28.92 
 
 
192 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5771  hypothetical protein  28.74 
 
 
177 aa  55.1  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3316  hypothetical protein  30.21 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  42.86 
 
 
857 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2459  Collagen triple helix repeat protein  39.47 
 
 
342 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
629 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0409  hypothetical protein  45.28 
 
 
782 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  42.55 
 
 
854 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2992  hypothetical protein  50 
 
 
781 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.507941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4827  hypothetical protein  26.4 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.788125  normal  0.10965 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3097  hypothetical protein  50 
 
 
781 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  34.71 
 
 
953 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>