48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_R0024 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_R0024  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0027  tRNA-Asn  98.55 
 
 		 76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000583067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0028  tRNA-Asn  98.55 
 
 		 76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000204522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0076  tRNA-Asn  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0034  tRNA-Asn  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0033  tRNA-Asn  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0077  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0054  tRNA-Asn  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00592499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0056  tRNA-Asn  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0035  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.365038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0027  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0016  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106062  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0025  tRNA-Asn  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.161646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1829  tRNA-Asn  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595078  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0001  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.432405  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0002  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.823848  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0048  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00987914  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0025  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00179903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0023  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.909867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1546  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0629  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0034  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 70 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822827  normal  0.513071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0032  tRNA-Asn  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172004  normal  0.954091 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0012  tRNA-Asn  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0645  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0011  tRNA-Asn  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000022551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0014  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0031  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0017  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt01  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt01  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0009  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000858246  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0010  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.026586  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0025  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.728693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0009  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.990057 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0014  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0013  tRNA-Asn  89.8 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0034  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0034  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60180  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0011  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000312741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0025  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000025626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0027  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167118  normal  0.501278 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_722  tRNA-Lys  84.75 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0023  tRNA-Lys  84.75 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.299591  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0016  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.032389  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  84.75 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.489322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0047  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0440889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>