25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_R0034 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_R0034  tRNA-Asn  100 
 
 		 70 bp  139  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822827  normal  0.513071 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0016  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0027  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0035  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.365038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0032  tRNA-Asn  97.92 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172004  normal  0.954091 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0014  tRNA-Asn  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1829  tRNA-Asn  95.83 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595078  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0025  tRNA-Asn  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.161646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0027  tRNA-Asn  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000583067  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0077  tRNA-Asn  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0076  tRNA-Asn  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0028  tRNA-Asn  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000204522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0012  tRNA-Asn  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0034  tRNA-Asn  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0033  tRNA-Asn  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0056  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0054  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00592499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0024  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00351824  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0025  tRNA-Asn  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.728693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0016  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0629  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1546  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0024  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104744  normal  0.385221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>