More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_R0016 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_R0016  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106062  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0035  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.365038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0027  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1829  tRNA-Asn  96.05 
 
 		 78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595078  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0032  tRNA-Asn  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172004  normal  0.954091 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0025  tRNA-Asn  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.161646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0014  tRNA-Asn  95.83 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0077  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0076  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0027  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000583067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0028  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000204522  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0034  tRNA-Asn  100 
 
 		 70 bp  95.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822827  normal  0.513071 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0054  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00592499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0033  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0034  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0056  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0012  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0024  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0629  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0025  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.728693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1546  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00351824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt01  tRNA-Asn  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt01  tRNA-Asn  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0010  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.026586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0009  tRNA-Asn  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.990057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0062  tRNA-Asn  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.6212e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0009  tRNA-Asn  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000858246  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0014  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0016  tRNA-Val  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0016  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.032389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0034  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0034  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.379435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0047  tRNA-Asn  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0440889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0013  tRNA-Asn  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0012  tRNA-Asn  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00142633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0027  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167118  normal  0.501278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t11  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.75816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t39  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.522109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA46  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00683435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA9  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000000314512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R31  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0567  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0645  tRNA-Asn  91.84 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0076  tRNA-Asn  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509004  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0049  tRNA-Asn  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0050  tRNA-Asn  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000354715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0051  tRNA-Asn  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000442391  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0193  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0031  tRNA-Asn  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0885898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0014  tRNA-Asn  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000105704  normal  0.0608768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0058  tRNA-Asn  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0024  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0043  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102089  hitchhiker  0.00032415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0014  tRNA-Phe  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4248  tRNA-Lys  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4247  tRNA-Lys  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000042551  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna43  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0012  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0023  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.051511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0021  tRNA-Asn  84.06 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00000256576  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0011  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0060  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0060  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.845098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0022  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0195324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0013  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60180  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0033  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0067  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0073  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0056  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.880886  decreased coverage  0.00985409 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26570  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000438766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0407  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000764097  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0408  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000233964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0076  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0078  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0075  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0071  tRNA-Asn  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0040  tRNA-Asn  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0275291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0015  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101097  hitchhiker  0.004712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0038  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0070  tRNA-Asn  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0015  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0057  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000331146  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0922112  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0025  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0044    85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0354  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.570155  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0018  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0458  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0049  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000790035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0060  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00703391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0061  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295696  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0075  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>