299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0016 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_R0016  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0072  tRNA-Val  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0089  tRNA-Val  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000177778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0090  tRNA-Val  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0011  tRNA-Val  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560887  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0078  tRNA-Val  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t48  tRNA-Val  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t50  tRNA-Val  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.220633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA26  tRNA-Val  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.241705  normal  0.163758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA28  tRNA-Val  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000265839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0046  tRNA-Val  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0031  tRNA-Val  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.03601e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R25  tRNA-Val  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112378  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R27  tRNA-Val  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000323391  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R36  tRNA-Val  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0052  tRNA-Val  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.599035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0072  tRNA-Val  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21800  tRNA-Val  88.41 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000344548  normal  0.0953285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24110  tRNA-Val  88.41 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000487057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2039  tRNA-Val  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1859  tRNA-Val  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00131515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0041  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5725  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0778  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34684e-29 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4578  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.0827232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5709  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000949158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5653  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000741856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5633  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0853  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000111044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0072  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0035  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5650  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000315313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5659  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000220141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5674  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000774972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5687  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000478099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5732  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5003  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4774  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000014475  hitchhiker  6.83474e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0212  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000868799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0036  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0045  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-2  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-3  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-4  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000645962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-5  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000098013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-6  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000153225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-1  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0417532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-3  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000052933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-4  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00757095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-5  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-6  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000716932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-7  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000452768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-1  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000230232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-2  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-3  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000779763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-5  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000106447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-6  tRNA-Val  89.06 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0143  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000199332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-1  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-2  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000053562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-3  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-4  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-6  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0018  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.010388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5666  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000870426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0139  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0018  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00275689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0114  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0064  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0147303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0170  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0237549 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0527  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3227999999999999e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0272  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5145  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000184879  normal  0.692523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0080  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000518886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0095  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5034  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000220203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5050  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000188833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0093  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000186576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0077  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5819  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000675228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0015  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0191  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000034986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0097  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000152963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0603  tRNA-Val  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000989267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0294  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0045  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0036  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0018  tRNA-Val  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0022012  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Val-1  tRNA-Val  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000143563  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Val-3  tRNA-Val  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0009  tRNA-Val  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000748453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0062  tRNA-Val  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0076  tRNA-Val  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0009  tRNA-Val  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000461705  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0062  tRNA-Val  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0076  tRNA-Val  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t28  tRNA-Val  86.96 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.199855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t43  tRNA-Val  86.96 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0556993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0036  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0086  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.211919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>