42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0048 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_R0048  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00987914  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0056  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0054  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00592499  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0001  tRNA-Asn  97.62 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.432405  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0002  tRNA-Asn  97.62 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.823848  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0025  tRNA-Asn  97.62 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00179903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0023  tRNA-Asn  97.62 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.909867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0027  tRNA-Asn  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000583067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0028  tRNA-Asn  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000204522  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0011  tRNA-Asn  95.35 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000022551  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0024  tRNA-Asn  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0033  tRNA-Asn  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0344077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0034  tRNA-Asn  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0076  tRNA-Asn  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0645  tRNA-Asn  93.02 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0077  tRNA-Asn  87.93 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0013  tRNA-Asn  95.12 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0007  tRNA-Asn  86.76 
 
 
75 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0004  tRNA-Asn  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0058  tRNA-Asn  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0922112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0048  tRNA-Asn  84 
 
 
76 bp  54  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0031  tRNA-Asn  85.51 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0017  tRNA-Asn  85.51 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0055  tRNA-Asn  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0297718  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0019  tRNA-Asn  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00742294  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0053  tRNA-Asn  84.21 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0280094  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0629  tRNA-Asn  82.89 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1546  tRNA-Asn  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0068  tRNA-Asn  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0018  tRNA-Asn  91.18 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857849  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0017  tRNA-Asn  91.18 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.808131  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0021  tRNA-Asn  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0071  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0070  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0051  tRNA-Asn  84.48 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0025  tRNA-Met  86.21 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244363  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0028  tRNA-Met  86.21 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0990905  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0051  tRNA-Asn  84.48 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0058  tRNA-Lys  84.48 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0567  tRNA-Asn  88.1 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>