62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0058 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_R0058  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0019  tRNA-Lys  91.04 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t36  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.3 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.489322  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0023  tRNA-Lys  87.3 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.299591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_722  tRNA-Lys  87.3 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0050  tRNA-Lys  87.3 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0025  tRNA-Lys  87.3 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.48259e-19 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0035  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0050  tRNA-Lys  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0044  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0696319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0048  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000334788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0027  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0025  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0050  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0029  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0019  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0030  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.455261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0078  tRNA-Lys  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0022  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0021  tRNA-Lys  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.0277835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0043  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0814782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0046  tRNA-Lys  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0025  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0028  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0990905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0020  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0043  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.438786  normal  0.486369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0044  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lplt33  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt33  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0029  tRNA-Lys  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000384489  normal  0.924155 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0034  tRNA-Lys  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24820  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.173239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0056  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0045  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0047  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0027  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0211133  hitchhiker  0.000000873105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0045  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0047  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0037  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0002  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t11  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.75816  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  96.3 
 
 		 1971 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t39  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.522109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA46  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00683435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA9  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000000314512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R31  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0012  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0021  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0056  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0048  tRNA-Asn  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00987914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0031  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0048  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.514987  normal  0.0153683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0013  tRNA-Lys  83.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0064  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0039  tRNA-Lys  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37540  tRNA-Lys  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0863573  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0030  tRNA-Lys  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0471674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0021  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0163136  normal  0.708975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>