More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0399 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0399  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  100 
 
 
121 aa  248  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2623  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  73.47 
 
 
115 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1882  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  72.45 
 
 
121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3075  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  61.96 
 
 
104 aa  120  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0733  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  67.06 
 
 
97 aa  120  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.527542  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1630  acetolactate synthase, small subunit  65.52 
 
 
96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.582859  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4184  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  60 
 
 
96 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4021  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  60 
 
 
96 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4076  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  60 
 
 
96 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4126  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  60 
 
 
96 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4005  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  60 
 
 
96 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03554  acetolactate synthase small subunit  63.86 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0033  acetolactate synthase, small subunit  63.86 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03496  hypothetical protein  63.86 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4249  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  58.43 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0029  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  63.86 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5103  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  63.86 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.094181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3883  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  63.86 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4179  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  63.86 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4037  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  63.86 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.662248 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3814  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  60.23 
 
 
97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0026  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  57.89 
 
 
95 aa  114  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1949  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  63.64 
 
 
115 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2288  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  63.64 
 
 
115 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3625  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  61.54 
 
 
103 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1838  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  63.64 
 
 
115 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0580  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  66.67 
 
 
97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0286747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  64.56 
 
 
98 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.7 
 
 
103 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.675263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0157  amino acid-binding ACT domain-containing protein  63.64 
 
 
130 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  42.47 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3237  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.03 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  47.14 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.98 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  40.96 
 
 
185 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
161 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.71 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  44.29 
 
 
207 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  38.96 
 
 
161 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1775  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.08 
 
 
164 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001648  acetolactate synthase small subunit  38.57 
 
 
164 aa  60.5  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00890505  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  39.74 
 
 
166 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  35.48 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00557  acetolactate synthase III, small subunit  41.27 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.79 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  42.86 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  39.51 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.8 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.47 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1164  acetolactate synthase, small subunit  44.93 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.686831  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2896  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.386622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2667  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.08 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000176129  decreased coverage  0.000698491 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.03 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00826  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  36.99 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2385  acetolactate synthase, small subunit  44.93 
 
 
173 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2278  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0187  acetolactate synthase, small subunit  36.9 
 
 
174 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.19 
 
 
174 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.28788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  32.61 
 
 
163 aa  57.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000667629  hitchhiker  0.0000555489 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3431  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.418353  normal  0.014642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.58 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.56 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.73 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1954  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0934233 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  39.71 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.96 
 
 
163 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  39.44 
 
 
172 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  40.3 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.73 
 
 
163 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1878  acetolactate synthase, small subunit  33.33 
 
 
177 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0996051 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  43.48 
 
 
167 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.52 
 
 
184 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.16 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0371  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.43 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13461  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.84 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18800  acetolactate synthase, small subunit  38.46 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.425298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.43 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0388  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.43 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.347574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.27 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.306169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1829  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.27 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2270  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.27 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493078  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2019  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.54 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128941  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1709  acetolactate synthase, small subunit  38.57 
 
 
175 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13311  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.84 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477847  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1309  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.71 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.71 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  35.14 
 
 
169 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1489  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.71 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.71 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.7 
 
 
163 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.68 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>