More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1619 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  100 
 
 
103 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.675263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3075  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  63.74 
 
 
104 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0733  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  65.17 
 
 
97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.527542  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3625  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  54.08 
 
 
103 aa  124  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0580  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  54.26 
 
 
97 aa  120  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0286747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  57.78 
 
 
98 aa  121  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3814  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.82 
 
 
97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4249  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  52.63 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03554  acetolactate synthase small subunit  51.58 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0033  acetolactate synthase, small subunit  51.58 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03496  hypothetical protein  51.58 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4179  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  51.58 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0029  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  51.58 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5103  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  51.58 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.094181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3883  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  51.58 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4037  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  51.58 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.662248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4021  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.32 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4184  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.32 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4076  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.32 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4126  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.32 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4005  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.32 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0026  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  55.17 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0399  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.7 
 
 
121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2623  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  54.08 
 
 
115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1838  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  52.27 
 
 
115 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1949  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  52.27 
 
 
115 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2288  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  52.27 
 
 
115 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1630  acetolactate synthase, small subunit  66.67 
 
 
96 aa  102  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.582859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1882  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.82 
 
 
121 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0157  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.98 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3237  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.21 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  42.17 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  39.08 
 
 
207 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  47.14 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  37.65 
 
 
170 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
163 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000667629  hitchhiker  0.0000555489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1954  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.36 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0934233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.73 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.343992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.48 
 
 
174 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2278  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.36 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1775  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.36 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0087  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.73 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.73 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.306169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1829  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2270  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493078  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  37.93 
 
 
162 aa  58.2  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2667  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.5 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000176129  decreased coverage  0.000698491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2139  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.44 
 
 
184 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3431  acetolactate synthase, small subunit  38.36 
 
 
166 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.418353  normal  0.014642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.63 
 
 
174 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.63 
 
 
174 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001648  acetolactate synthase small subunit  38.89 
 
 
164 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00890505  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.02 
 
 
161 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18800  acetolactate synthase, small subunit  36.59 
 
 
171 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.425298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2019  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.36 
 
 
164 aa  57  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128941  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0904  acetolactate synthase, small subunit  39.74 
 
 
242 aa  57  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0635  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.29 
 
 
163 aa  57  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.36 
 
 
163 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00080  acetolactate synthase small subunit  36.99 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3521  acetolactate synthase, small subunit  36.99 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.59 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0128  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.480792  hitchhiker  0.000114859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.47 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.24 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  38.37 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3400  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.33 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0129  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.942992  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3530  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.33 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00079  hypothetical protein  36.99 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3604  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.36 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.28 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1627  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.800745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0072  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3792  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.36 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0597  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.12 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.539091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3579  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0080  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2931  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.33 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3229  acetolactate synthase, small subunit  36.59 
 
 
167 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0126  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00826  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.89 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  37.65 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.84 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10840  acetolactate synthase, small subunit  40.7 
 
 
168 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  36.14 
 
 
174 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2491  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126247  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1972  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0607984  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00557  acetolactate synthase III, small subunit  36.11 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1409  acetolactate synthase, small subunit  34.48 
 
 
174 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.678038 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2705  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.75 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.5 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2387  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474277  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0812  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.65 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2375  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.99 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0991612  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  36.67 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>