299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3625 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3625  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  100 
 
 
103 aa  215  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3814  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  95.83 
 
 
97 aa  192  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0580  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  86.17 
 
 
97 aa  173  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0286747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  85.57 
 
 
98 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0733  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  74.74 
 
 
97 aa  154  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.527542  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2288  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  73.96 
 
 
115 aa  147  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1838  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  73.96 
 
 
115 aa  147  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1949  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  73.96 
 
 
115 aa  147  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3075  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  65.59 
 
 
104 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4249  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.64 
 
 
96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03554  acetolactate synthase small subunit  62.64 
 
 
96 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0033  acetolactate synthase, small subunit  62.64 
 
 
96 aa  131  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4037  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.64 
 
 
96 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.662248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5103  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.64 
 
 
96 aa  131  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.094181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3883  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.64 
 
 
96 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03496  hypothetical protein  62.64 
 
 
96 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0029  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.64 
 
 
96 aa  131  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4179  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.64 
 
 
96 aa  131  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4076  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.64 
 
 
96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4021  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.64 
 
 
96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4184  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.64 
 
 
96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4005  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.64 
 
 
96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4126  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.64 
 
 
96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0026  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  60.22 
 
 
95 aa  127  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  54.08 
 
 
103 aa  124  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.675263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1882  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  65.88 
 
 
121 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0399  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  61.54 
 
 
121 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1630  acetolactate synthase, small subunit  58.43 
 
 
96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.582859  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2623  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  61.18 
 
 
115 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0157  amino acid-binding ACT domain-containing protein  53.85 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  47.83 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  47.14 
 
 
207 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  40.28 
 
 
170 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
176 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  35.71 
 
 
170 aa  60.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3237  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.36 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1977  acetolactate synthase, small subunit  35.37 
 
 
178 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1986  acetolactate synthase, small subunit  35.37 
 
 
178 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1989  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.43 
 
 
176 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.609838  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1901  acetolactate synthase, small subunit  35.37 
 
 
178 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518897  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  37.21 
 
 
167 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  42.03 
 
 
167 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
174 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1409  acetolactate synthase, small subunit  41.43 
 
 
174 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.678038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  39.44 
 
 
169 aa  57.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
172 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1043  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.75 
 
 
184 aa  57  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.678602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18800  acetolactate synthase, small subunit  38.67 
 
 
171 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.425298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  38.57 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  39.47 
 
 
185 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  38.57 
 
 
172 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  38.57 
 
 
172 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1164  acetolactate synthase, small subunit  42.86 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.686831  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1709  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10840  acetolactate synthase, small subunit  42.03 
 
 
168 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  40.85 
 
 
172 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.14 
 
 
184 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2385  acetolactate synthase, small subunit  42.86 
 
 
173 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0904  acetolactate synthase, small subunit  40.91 
 
 
242 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.19 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  38.89 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2896  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.386622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1878  acetolactate synthase, small subunit  34.62 
 
 
177 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0996051 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
172 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  41.67 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
172 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
172 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  38.57 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.44 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.28788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.44 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13461  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  37.14 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13311  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.5 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2768  acetolactate synthase, small subunit  39.39 
 
 
221 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.71 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4355  acetolactate synthase small subunit  40 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00134295  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13211  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.463823  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
167 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.54 
 
 
182 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.33 
 
 
163 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000667629  hitchhiker  0.0000555489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
172 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.14 
 
 
170 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
167 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3021  acetolactate synthase, small subunit  34.18 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000136695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1124  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539849  hitchhiker  0.0000778154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  37.14 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4072  acetolactate synthase, small subunit  37.14 
 
 
175 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1467  acetolactate synthase, small subunit  38.57 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000490839  normal  0.0250967 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1234  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.14 
 
 
169 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1775  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.36 
 
 
164 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>