More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0157 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0157  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 
130 aa  262  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1882  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  49.22 
 
 
121 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0399  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  63.64 
 
 
121 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3625  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  53.85 
 
 
103 aa  100  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3814  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  52.75 
 
 
97 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0733  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  59.26 
 
 
97 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.527542  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3075  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  59.04 
 
 
104 aa  97.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1630  acetolactate synthase, small subunit  56.47 
 
 
96 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.582859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  49.47 
 
 
98 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03554  acetolactate synthase small subunit  56.94 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0033  acetolactate synthase, small subunit  56.94 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4037  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.94 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.662248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0029  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.94 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03496  hypothetical protein  56.94 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5103  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.94 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.094181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3883  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.94 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4179  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.94 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0580  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  51.61 
 
 
97 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0286747  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4249  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  54.79 
 
 
96 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0026  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.58 
 
 
95 aa  90.5  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2623  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  58.02 
 
 
115 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4005  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.58 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4184  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.58 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4021  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.58 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4076  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.58 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4126  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  56.58 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  53.33 
 
 
103 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.675263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1949  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  55.84 
 
 
115 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2288  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  55.84 
 
 
115 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1838  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  55.84 
 
 
115 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001648  acetolactate synthase small subunit  43.06 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00890505  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  46.48 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1775  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.67 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2019  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128941  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1954  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.28 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0934233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2278  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.67 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00826  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.67 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2667  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.67 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000176129  decreased coverage  0.000698491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.43 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.306169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1829  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.43 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2270  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.43 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493078  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.343992  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  42.86 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  43.59 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1627  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.800745  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.25 
 
 
161 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2139  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.28 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1910  acetolactate synthase, small subunit  46.03 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1972  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.28 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0607984  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.38 
 
 
170 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2387  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.28 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474277  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.28 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0087  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2375  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.28 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0991612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2491  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.28 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126247  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00080  acetolactate synthase small subunit  44.29 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3521  acetolactate synthase, small subunit  44.29 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0128  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.480792  hitchhiker  0.000114859 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0126  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3792  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0597  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.539091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  45.71 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.48 
 
 
172 aa  62  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3579  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0129  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.942992  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  33.72 
 
 
166 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3604  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0072  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00079  hypothetical protein  44.29 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0080  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0635  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.15 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  44.44 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.15 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  41.33 
 
 
162 aa  61.6  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0625  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.29 
 
 
163 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22823 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3021  acetolactate synthase, small subunit  40.54 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000136695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.62 
 
 
163 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  45.07 
 
 
169 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.03 
 
 
168 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.56 
 
 
163 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3237  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.67 
 
 
165 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.62 
 
 
163 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2705  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.33 
 
 
164 aa  60.5  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.48 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3530  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.48 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  39.13 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.48 
 
 
174 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2931  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
184 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3400  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  39.19 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.84 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  43.48 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>