26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2788 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2788  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4575  Protein of unknown function DUF1847  74.77 
 
 
218 aa  362  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000363898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1064  Protein of unknown function DUF1847  60.93 
 
 
219 aa  278  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.253375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1986  hypothetical protein  58.8 
 
 
226 aa  275  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1219  Protein of unknown function DUF1847  58.69 
 
 
226 aa  270  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000101806  hitchhiker  0.00063854 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2021  hypothetical protein  58.94 
 
 
222 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.457278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2679  Protein of unknown function DUF1847  59.13 
 
 
221 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1436  Protein of unknown function DUF1847  59.71 
 
 
226 aa  264  8.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0127  hypothetical protein  47.21 
 
 
243 aa  203  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0197802  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0104  Protein of unknown function DUF1847  47.79 
 
 
241 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0086  Protein of unknown function DUF1847  47.79 
 
 
241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43245e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0284  hypothetical protein  48.92 
 
 
243 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3326  hypothetical protein  44.64 
 
 
243 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0096  hypothetical protein  52.43 
 
 
209 aa  188  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.740238  hitchhiker  0.00737296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3043  hypothetical protein  43.05 
 
 
225 aa  184  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0656  hypothetical protein  50.72 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3053  hypothetical protein  43.5 
 
 
225 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1805  hypothetical protein  50.97 
 
 
209 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.251054  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2077  hypothetical protein  46.38 
 
 
191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2927  Protein of unknown function DUF1847  50.32 
 
 
196 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.727853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1137  hypothetical protein  44.39 
 
 
200 aa  144  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000486783  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0459  Protein of unknown function DUF1847  42.6 
 
 
223 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1395  hypothetical protein  36.49 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1050  hypothetical protein  36.1 
 
 
197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0564  hypothetical protein  39.86 
 
 
167 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0637  hypothetical protein  46.22 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>