26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1064 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1064  Protein of unknown function DUF1847  100 
 
 
219 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.253375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2788  hypothetical protein  60.93 
 
 
218 aa  278  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4575  Protein of unknown function DUF1847  58.77 
 
 
218 aa  271  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000363898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1986  hypothetical protein  58.18 
 
 
226 aa  265  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1436  Protein of unknown function DUF1847  59.02 
 
 
226 aa  260  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2021  hypothetical protein  57.07 
 
 
222 aa  259  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.457278 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1219  Protein of unknown function DUF1847  55.87 
 
 
226 aa  251  8.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000101806  hitchhiker  0.00063854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2679  Protein of unknown function DUF1847  50 
 
 
221 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0127  hypothetical protein  44.35 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0197802  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0104  Protein of unknown function DUF1847  42.74 
 
 
241 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0086  Protein of unknown function DUF1847  42.31 
 
 
241 aa  188  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43245e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0284  hypothetical protein  43.16 
 
 
243 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3326  hypothetical protein  42.67 
 
 
243 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0096  hypothetical protein  46.48 
 
 
209 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.740238  hitchhiker  0.00737296 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0656  hypothetical protein  45.75 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1805  hypothetical protein  44.34 
 
 
209 aa  168  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.251054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3043  hypothetical protein  42.72 
 
 
225 aa  168  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3053  hypothetical protein  42.72 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2927  Protein of unknown function DUF1847  40.69 
 
 
196 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.727853 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2077  hypothetical protein  40.69 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0459  Protein of unknown function DUF1847  38.81 
 
 
223 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1050  hypothetical protein  40.68 
 
 
197 aa  131  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1137  hypothetical protein  38.58 
 
 
200 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000486783  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1395  hypothetical protein  42.5 
 
 
199 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0564  hypothetical protein  38.35 
 
 
167 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0637  hypothetical protein  39.02 
 
 
177 aa  72  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>