26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0564 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0564  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  342  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2927  Protein of unknown function DUF1847  45.19 
 
 
196 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.727853 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2077  hypothetical protein  39.35 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0096  hypothetical protein  37.28 
 
 
209 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.740238  hitchhiker  0.00737296 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0656  hypothetical protein  38.82 
 
 
209 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3043  hypothetical protein  40.91 
 
 
225 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1805  hypothetical protein  38.24 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.251054  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2679  Protein of unknown function DUF1847  38.79 
 
 
221 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3053  hypothetical protein  39.61 
 
 
225 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0086  Protein of unknown function DUF1847  39.72 
 
 
241 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43245e-18 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1395  hypothetical protein  42.52 
 
 
199 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0104  Protein of unknown function DUF1847  40.6 
 
 
241 aa  104  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0284  hypothetical protein  40.6 
 
 
243 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100661  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1219  Protein of unknown function DUF1847  41.3 
 
 
226 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000101806  hitchhiker  0.00063854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3326  hypothetical protein  36.81 
 
 
243 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0127  hypothetical protein  38.35 
 
 
243 aa  99  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0197802  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2788  hypothetical protein  39.86 
 
 
218 aa  97.4  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4575  Protein of unknown function DUF1847  41.3 
 
 
218 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000363898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1050  hypothetical protein  33.72 
 
 
197 aa  95.5  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2021  hypothetical protein  42.11 
 
 
222 aa  94.7  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.457278 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1986  hypothetical protein  39.13 
 
 
226 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1436  Protein of unknown function DUF1847  38.35 
 
 
226 aa  92.8  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1137  hypothetical protein  32.37 
 
 
200 aa  92  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000486783  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1064  Protein of unknown function DUF1847  38.35 
 
 
219 aa  90.5  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.253375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0459  Protein of unknown function DUF1847  34.35 
 
 
223 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0637  hypothetical protein  32.14 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>