26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0459 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0459  Protein of unknown function DUF1847  100 
 
 
223 aa  461  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3043  hypothetical protein  48.18 
 
 
225 aa  208  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3053  hypothetical protein  46.82 
 
 
225 aa  204  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0096  hypothetical protein  39.91 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.740238  hitchhiker  0.00737296 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0656  hypothetical protein  39.53 
 
 
209 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1805  hypothetical protein  38.97 
 
 
209 aa  141  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.251054  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1064  Protein of unknown function DUF1847  38.81 
 
 
219 aa  137  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.253375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2788  hypothetical protein  42.6 
 
 
218 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4575  Protein of unknown function DUF1847  41.52 
 
 
218 aa  134  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000363898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0127  hypothetical protein  36.22 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0197802  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3326  hypothetical protein  33.91 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2021  hypothetical protein  38.83 
 
 
222 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.457278 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0086  Protein of unknown function DUF1847  37.31 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43245e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0104  Protein of unknown function DUF1847  37.19 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193044  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1219  Protein of unknown function DUF1847  45 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000101806  hitchhiker  0.00063854 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1395  hypothetical protein  48.15 
 
 
199 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1436  Protein of unknown function DUF1847  43.57 
 
 
226 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2679  Protein of unknown function DUF1847  36.36 
 
 
221 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1986  hypothetical protein  42.86 
 
 
226 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0284  hypothetical protein  35.32 
 
 
243 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1137  hypothetical protein  33.66 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000486783  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2077  hypothetical protein  44.44 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2927  Protein of unknown function DUF1847  41.96 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.727853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1050  hypothetical protein  39.08 
 
 
197 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0564  hypothetical protein  34.35 
 
 
167 aa  85.9  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0637  hypothetical protein  36.07 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>