26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3326 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3326  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0127  hypothetical protein  81.89 
 
 
243 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0197802  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0284  hypothetical protein  75 
 
 
243 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0086  Protein of unknown function DUF1847  71.43 
 
 
241 aa  345  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43245e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0104  Protein of unknown function DUF1847  70.56 
 
 
241 aa  341  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193044  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2021  hypothetical protein  47.81 
 
 
222 aa  204  7e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.457278 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2788  hypothetical protein  44.64 
 
 
218 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1986  hypothetical protein  45.12 
 
 
226 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1219  Protein of unknown function DUF1847  41.92 
 
 
226 aa  186  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000101806  hitchhiker  0.00063854 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1436  Protein of unknown function DUF1847  42.31 
 
 
226 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4575  Protein of unknown function DUF1847  50.85 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000363898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2679  Protein of unknown function DUF1847  45.18 
 
 
221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1064  Protein of unknown function DUF1847  42.67 
 
 
219 aa  181  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.253375  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0096  hypothetical protein  43.56 
 
 
209 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.740238  hitchhiker  0.00737296 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1805  hypothetical protein  41.1 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.251054  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0656  hypothetical protein  40.27 
 
 
209 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3043  hypothetical protein  36.32 
 
 
225 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2077  hypothetical protein  41.83 
 
 
191 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3053  hypothetical protein  37.25 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0459  Protein of unknown function DUF1847  33.91 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2927  Protein of unknown function DUF1847  45.83 
 
 
196 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.727853 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1395  hypothetical protein  46.48 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1137  hypothetical protein  36.02 
 
 
200 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000486783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1050  hypothetical protein  39.57 
 
 
197 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0564  hypothetical protein  36.81 
 
 
167 aa  99.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0637  hypothetical protein  34.88 
 
 
177 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>