26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3053 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3053  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3043  hypothetical protein  96.44 
 
 
225 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0459  Protein of unknown function DUF1847  46.82 
 
 
223 aa  204  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0656  hypothetical protein  48.73 
 
 
209 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4575  Protein of unknown function DUF1847  43.05 
 
 
218 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000363898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2788  hypothetical protein  43.5 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1805  hypothetical protein  52.38 
 
 
209 aa  181  7e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.251054  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0096  hypothetical protein  46.7 
 
 
209 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.740238  hitchhiker  0.00737296 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2021  hypothetical protein  39.82 
 
 
222 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.457278 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1064  Protein of unknown function DUF1847  42.72 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.253375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1986  hypothetical protein  39.32 
 
 
226 aa  158  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2679  Protein of unknown function DUF1847  39.82 
 
 
221 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0127  hypothetical protein  38.5 
 
 
243 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0197802  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0284  hypothetical protein  41.21 
 
 
243 aa  154  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100661  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1436  Protein of unknown function DUF1847  46.21 
 
 
226 aa  154  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0104  Protein of unknown function DUF1847  40.1 
 
 
241 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0086  Protein of unknown function DUF1847  41.41 
 
 
241 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43245e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2927  Protein of unknown function DUF1847  41.67 
 
 
196 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.727853 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1219  Protein of unknown function DUF1847  46.21 
 
 
226 aa  148  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000101806  hitchhiker  0.00063854 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1395  hypothetical protein  55 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3326  hypothetical protein  37.25 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2077  hypothetical protein  50 
 
 
191 aa  135  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1137  hypothetical protein  36.92 
 
 
200 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000486783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1050  hypothetical protein  43.88 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0564  hypothetical protein  39.61 
 
 
167 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0637  hypothetical protein  40.98 
 
 
177 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>