26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1436 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1436  Protein of unknown function DUF1847  100 
 
 
226 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1986  hypothetical protein  78.76 
 
 
226 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1219  Protein of unknown function DUF1847  77.78 
 
 
226 aa  348  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000101806  hitchhiker  0.00063854 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2021  hypothetical protein  70 
 
 
222 aa  314  9e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.457278 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2788  hypothetical protein  59.71 
 
 
218 aa  271  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4575  Protein of unknown function DUF1847  57.97 
 
 
218 aa  267  8.999999999999999e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000363898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1064  Protein of unknown function DUF1847  59.02 
 
 
219 aa  266  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.253375  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2679  Protein of unknown function DUF1847  55.02 
 
 
221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0127  hypothetical protein  44.68 
 
 
243 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0197802  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0284  hypothetical protein  45.18 
 
 
243 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3326  hypothetical protein  42.31 
 
 
243 aa  193  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0086  Protein of unknown function DUF1847  43.78 
 
 
241 aa  191  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43245e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0104  Protein of unknown function DUF1847  43.35 
 
 
241 aa  190  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193044  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0096  hypothetical protein  40.95 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.740238  hitchhiker  0.00737296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3043  hypothetical protein  37.86 
 
 
225 aa  161  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0656  hypothetical protein  42.36 
 
 
209 aa  161  7e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1805  hypothetical protein  42.57 
 
 
209 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.251054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3053  hypothetical protein  37.86 
 
 
225 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2077  hypothetical protein  40.49 
 
 
191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2927  Protein of unknown function DUF1847  45.75 
 
 
196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.727853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1050  hypothetical protein  44.79 
 
 
197 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0459  Protein of unknown function DUF1847  36.95 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1137  hypothetical protein  37.44 
 
 
200 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000486783  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1395  hypothetical protein  44.52 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0564  hypothetical protein  36.54 
 
 
167 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0637  hypothetical protein  36.99 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>