More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3416 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3416  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1020 aa  2097    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257508  normal  0.239752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  40.1 
 
 
3207 aa  403  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3409  amino acid adenylation domain protein  39.08 
 
 
1056 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  0.154555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  27.05 
 
 
4196 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  33.59 
 
 
3718 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.79 
 
 
6889 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  30.08 
 
 
4080 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  31.58 
 
 
2867 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  37.65 
 
 
1525 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.96 
 
 
3176 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  37.44 
 
 
4531 aa  363  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6474  amino acid adenylation domain-containing protein  37.16 
 
 
1304 aa  363  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.571102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  37.04 
 
 
6676 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  31.75 
 
 
7122 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.75 
 
 
13537 aa  357  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  30.58 
 
 
3086 aa  357  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  30.58 
 
 
3086 aa  357  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  35.49 
 
 
1082 aa  356  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.33 
 
 
1082 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  35.33 
 
 
1082 aa  354  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  29.81 
 
 
1816 aa  355  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  29.77 
 
 
3308 aa  354  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.09 
 
 
2370 aa  353  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  35.16 
 
 
1533 aa  353  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  30.2 
 
 
2508 aa  353  8.999999999999999e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  37.02 
 
 
4383 aa  353  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.17 
 
 
1082 aa  352  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  34.57 
 
 
1345 aa  352  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.17 
 
 
1082 aa  352  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.17 
 
 
1071 aa  352  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  35.4 
 
 
3639 aa  352  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.17 
 
 
1082 aa  352  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.87 
 
 
4968 aa  350  6e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  29.73 
 
 
3498 aa  350  8e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  36.44 
 
 
1336 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  34.68 
 
 
1518 aa  349  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  34.68 
 
 
1518 aa  349  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.78 
 
 
3231 aa  348  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2386  amino acid adenylation domain protein  32 
 
 
1893 aa  347  6e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  36.75 
 
 
3291 aa  346  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  33.48 
 
 
2410 aa  346  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  36.53 
 
 
6661 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  29.72 
 
 
3114 aa  345  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  30.51 
 
 
1528 aa  344  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  34.52 
 
 
1518 aa  344  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  32.69 
 
 
3374 aa  343  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.38 
 
 
4336 aa  343  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  29.9 
 
 
4960 aa  343  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3029  amino acid adenylation domain protein  35.16 
 
 
1533 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  29.75 
 
 
4960 aa  342  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  29.68 
 
 
1833 aa  342  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  33.92 
 
 
5469 aa  341  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  33.93 
 
 
5926 aa  341  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.03 
 
 
4336 aa  340  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  27.15 
 
 
1922 aa  338  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.24 
 
 
8646 aa  337  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  29.91 
 
 
9175 aa  337  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  32.09 
 
 
1525 aa  336  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  33.77 
 
 
2752 aa  336  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  35.2 
 
 
2176 aa  335  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  32.97 
 
 
5929 aa  335  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2106  amino acid adenylation domain-containing protein  34.2 
 
 
1927 aa  335  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  33.87 
 
 
1439 aa  335  3e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  32.68 
 
 
1069 aa  335  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  35.52 
 
 
1405 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  36.52 
 
 
2628 aa  333  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  29.15 
 
 
1553 aa  333  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  31.7 
 
 
5372 aa  333  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2102  amino acid adenylation domain-containing protein  32.9 
 
 
1481 aa  333  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.73819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  36.72 
 
 
3650 aa  332  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  30.37 
 
 
2193 aa  332  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  35.85 
 
 
5230 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  33.09 
 
 
3395 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  30.73 
 
 
6202 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  30.36 
 
 
4991 aa  331  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  33.89 
 
 
2156 aa  331  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  34.67 
 
 
2156 aa  331  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  35.02 
 
 
2164 aa  331  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  34.52 
 
 
2626 aa  330  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  31.13 
 
 
5738 aa  330  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  35.88 
 
 
2581 aa  330  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  34.37 
 
 
2419 aa  330  9e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  34.27 
 
 
2156 aa  330  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  33.5 
 
 
888 aa  329  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  30.55 
 
 
7712 aa  328  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  33.98 
 
 
2033 aa  327  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  30.75 
 
 
2201 aa  327  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  34.16 
 
 
627 aa  327  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  35.38 
 
 
6081 aa  326  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  34.06 
 
 
3235 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33.5 
 
 
5953 aa  325  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  34.62 
 
 
8915 aa  326  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  33.58 
 
 
2571 aa  326  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  33.58 
 
 
2571 aa  326  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  30.24 
 
 
1786 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  33.73 
 
 
5422 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  29.81 
 
 
4332 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  35.04 
 
 
1137 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  33.54 
 
 
2386 aa  324  5e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  33.95 
 
 
4502 aa  324  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>