More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3409 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3409  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 1056 aa  2175    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  0.154555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  35.05 
 
 		 3207 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  32.42 
 
 		 4080 aa  465  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  30.36 
 
 		 1466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  29.5 
 
 		 1345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  29.98 
 
 		 1466 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  30.08 
 
 		 4196 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  28.9 
 
 		 1833 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  29.61 
 
 		 1525 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  29.6 
 
 		 3718 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  29.15 
 
 		 2508 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  29.21 
 
 		 2581 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  29.27 
 
 		 1525 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  28.02 
 
 		 3395 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  30.46 
 
 		 2867 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3416  amino acid adenylation domain protein  39.08 
 
 		 1020 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257508  normal  0.239752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  29.98 
 
 		 5929 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.85 
 
 		 2385 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  28.89 
 
 		 7122 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.76 
 
 		 2385 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.74 
 
 		 2385 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.82 
 
 		 4968 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  28.57 
 
 		 1816 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  29.49 
 
 		 3308 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  30.21 
 
 		 1569 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  28.26 
 
 		 6202 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  29.1 
 
 		 3291 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  27.9 
 
 		 2156 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  28.79 
 
 		 5926 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  29.6 
 
 		 3498 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  28.34 
 
 		 1533 aa  380  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.2 
 
 		 2385 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.48 
 
 		 2385 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  28.77 
 
 		 6676 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  28.33 
 
 		 5738 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  29.31 
 
 		 6661 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  27.89 
 
 		 9175 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  28.4 
 
 		 2156 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  28.17 
 
 		 2386 aa  373  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.48 
 
 		 2385 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  29.23 
 
 		 1518 aa  373  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  28.41 
 
 		 2385 aa  373  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  28.77 
 
 		 4960 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  28.77 
 
 		 1383 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  27.9 
 
 		 2156 aa  372  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.48 
 
 		 2385 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  34.69 
 
 		 1922 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  28.36 
 
 		 3086 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  27.77 
 
 		 2164 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  27.9 
 
 		 2385 aa  369  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  28.36 
 
 		 3086 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  28.49 
 
 		 4960 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  28.43 
 
 		 3639 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3029  amino acid adenylation domain protein  28.34 
 
 		 1533 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  28.85 
 
 		 1786 aa  366  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2386  amino acid adenylation domain protein  35.97 
 
 		 1893 aa  365  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  29.26 
 
 		 1518 aa  364  6e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  28.96 
 
 		 2439 aa  363  8e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  28.19 
 
 		 2410 aa  363  8e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  28.77 
 
 		 2033 aa  363  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  27.44 
 
 		 3453 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  27.26 
 
 		 13537 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  28.22 
 
 		 2386 aa  361  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2390  amino acid adenylation domain protein  30.7 
 
 		 1490 aa  361  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.215425  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  27.09 
 
 		 2439 aa  360  8e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  28.53 
 
 		 6889 aa  359  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1678  amino acid adenylation domain protein  29.83 
 
 		 1393 aa  359  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  27.79 
 
 		 1556 aa  359  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  27.96 
 
 		 1556 aa  359  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  27.89 
 
 		 2006 aa  358  2.9999999999999997e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.58 
 
 		 4531 aa  356  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  31.87 
 
 		 5469 aa  356  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  28.36 
 
 		 2752 aa  356  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  28.72 
 
 		 2894 aa  356  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  36.76 
 
 		 1518 aa  355  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  28.58 
 
 		 3002 aa  356  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  37.35 
 
 		 4383 aa  355  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  28.81 
 
 		 1405 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  26.85 
 
 		 4502 aa  355  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  29.86 
 
 		 6081 aa  354  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  29.9 
 
 		 1870 aa  354  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  28.25 
 
 		 4882 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  28.32 
 
 		 4342 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  28.81 
 
 		 3021 aa  353  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  27.96 
 
 		 2681 aa  353  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  28.69 
 
 		 1689 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  27.89 
 
 		 3695 aa  353  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  27.46 
 
 		 4342 aa  353  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  27.32 
 
 		 2054 aa  352  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1967  amino acid adenylation domain-containing protein  27.88 
 
 		 1087 aa  352  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  29.69 
 
 		 1870 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  28.65 
 
 		 5596 aa  352  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  29.53 
 
 		 1578 aa  351  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  27.78 
 
 		 2419 aa  351  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  29.98 
 
 		 3102 aa  351  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  27.67 
 
 		 3018 aa  351  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  28.03 
 
 		 2628 aa  350  6e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  27.69 
 
 		 5149 aa  350  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  29.98 
 
 		 4468 aa  350  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  27.15 
 
 		 3374 aa  349  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>