153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1610 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1610  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  414  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0870  hypothetical protein  41.26 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00308368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0857  hypothetical protein  41.26 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  37.7 
 
 		 289 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  37.5 
 
 		 290 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4769  hypothetical protein  31.71 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4768  hypothetical protein  31.71 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0493  hypothetical protein  31.03 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4464  hypothetical protein  32.2 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4531  hypothetical protein  31.22 
 
 		 220 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4367  hypothetical protein  31.22 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4378  hypothetical protein  31.22 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4884  hypothetical protein  31.22 
 
 		 220 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4751  hypothetical protein  31.22 
 
 		 220 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4742  hypothetical protein  30.54 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0590528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3308  hypothetical protein  30.85 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00455956  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0907  hypothetical protein  32.14 
 
 		 296 aa  96.3  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00009581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  31.72 
 
 		 293 aa  96.3  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  28.8 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  31.18 
 
 		 293 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  29.84 
 
 		 293 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  29.84 
 
 		 293 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  29.84 
 
 		 293 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  29.84 
 
 		 293 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  29.84 
 
 		 293 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  29.84 
 
 		 293 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  29.84 
 
 		 293 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  31.11 
 
 		 293 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  31.11 
 
 		 293 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0203  hypothetical protein  31.69 
 
 		 278 aa  89  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2223  hypothetical protein  31.94 
 
 		 294 aa  89  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000101287  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0748  hypothetical protein  30.3 
 
 		 295 aa  87.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.796789  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0228  yitT family protein  30.05 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0210  yitT family protein  30.05 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0235  yitT family protein  30.05 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0196  hypothetical protein  30.05 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.851419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0200  hypothetical protein  30.05 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0218  yitT family protein  30.05 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0196  hypothetical protein  30.05 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5091  yitT family protein  29.51 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0234  yitT family protein  28.96 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0253  yitT family protein  28.96 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  28.73 
 
 		 292 aa  78.6  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2224  hypothetical protein  29.44 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00399664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  28.06 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0780  hypothetical protein  34.64 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0139128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  34.78 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  32.26 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  28.28 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0669  hypothetical protein  28.26 
 
 		 277 aa  71.6  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.866307  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0684  hypothetical protein  28.26 
 
 		 277 aa  71.6  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  30.89 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  33.97 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0885  protein of unknown function DUF161  30.65 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000434482  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0305  hypothetical protein  27.42 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2110  hypothetical protein  26.09 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  29.65 
 
 		 311 aa  65.5  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  22.56 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  27.42 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  24.49 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2267  protein of unknown function DUF161  31.76 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  29.61 
 
 		 281 aa  62  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  28.02 
 
 		 279 aa  62  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  26.56 
 
 		 287 aa  62  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  25.6 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0290  hypothetical protein  29.38 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000120699  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  27.44 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1873  protein of unknown function DUF161  27.68 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.83834  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0295  hypothetical protein  28.87 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  22.64 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  26.7 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3612  hypothetical protein  25.41 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0536  hypothetical protein  24.74 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  24.08 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  23.32 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  24.6 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  25.37 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  27.27 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  27.91 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  24.6 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  28.5 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0743  hypothetical protein  26.35 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108912  hitchhiker  0.0000688961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  26.37 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2353  protein of unknown function DUF161  28.57 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  27.46 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  24.14 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  28.12 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  22.8 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  25.61 
 
 		 287 aa  54.3  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0930  hypothetical protein  25.65 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0214742  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  25.93 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1868  hypothetical protein  23.38 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.237557  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  23.88 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  24.88 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  23.86 
 
 		 288 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  27.78 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0771  hypothetical protein  23.47 
 
 		 283 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103591  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  24.04 
 
 		 322 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  25.95 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0880  hypothetical protein  26.35 
 
 		 285 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>