161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0870 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0870  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00308368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0857  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4531  hypothetical protein  33.82 
 
 
220 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4367  hypothetical protein  33.82 
 
 
220 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4378  hypothetical protein  33.82 
 
 
220 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4884  hypothetical protein  33.82 
 
 
220 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4751  hypothetical protein  33.82 
 
 
220 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4742  hypothetical protein  33.82 
 
 
220 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0590528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4464  hypothetical protein  34.31 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4769  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4768  hypothetical protein  32.84 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0493  hypothetical protein  32.35 
 
 
220 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3308  hypothetical protein  35.03 
 
 
216 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00455956  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1610  hypothetical protein  41.26 
 
 
210 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  34.27 
 
 
289 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  31.02 
 
 
290 aa  122  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  34.68 
 
 
293 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  34.22 
 
 
293 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  34.22 
 
 
293 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  34.22 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  34.22 
 
 
293 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  34.22 
 
 
293 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  33.78 
 
 
293 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  33.75 
 
 
293 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  33.75 
 
 
293 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  34.15 
 
 
290 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0907  hypothetical protein  35.2 
 
 
296 aa  105  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00009581 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0748  hypothetical protein  32.43 
 
 
295 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.796789  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2223  hypothetical protein  34.03 
 
 
294 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000101287  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0669  hypothetical protein  30.65 
 
 
277 aa  99.4  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.866307  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0684  hypothetical protein  30.65 
 
 
277 aa  99.4  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0210  yitT family protein  32.49 
 
 
278 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0196  hypothetical protein  32.49 
 
 
278 aa  98.2  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.851419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0200  hypothetical protein  32.49 
 
 
278 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0228  yitT family protein  32.49 
 
 
278 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0218  yitT family protein  32.49 
 
 
278 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2224  hypothetical protein  33.5 
 
 
291 aa  98.6  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00399664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0234  yitT family protein  31.98 
 
 
278 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0253  yitT family protein  31.98 
 
 
278 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0235  yitT family protein  32.49 
 
 
278 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5091  yitT family protein  31.98 
 
 
278 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0203  hypothetical protein  32.49 
 
 
278 aa  95.5  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0196  hypothetical protein  30.96 
 
 
278 aa  95.1  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0305  hypothetical protein  29.15 
 
 
277 aa  89.4  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  28.44 
 
 
294 aa  88.2  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  29.47 
 
 
295 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  27.75 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  29.53 
 
 
286 aa  78.2  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  31.52 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  27.51 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0780  hypothetical protein  31.1 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0139128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2110  hypothetical protein  26.4 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1070  hypothetical protein  28.43 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0295  hypothetical protein  30.46 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  23.7 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0290  hypothetical protein  29.95 
 
 
285 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000120699  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  25.7 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2616  protein of unknown function DUF161  28.36 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000720176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  25.7 
 
 
289 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  25.63 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0760  hypothetical protein  23.36 
 
 
287 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455591  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  26.87 
 
 
287 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  26.15 
 
 
283 aa  62.4  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  24.74 
 
 
292 aa  62.4  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  27.32 
 
 
311 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  23.04 
 
 
299 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  27.69 
 
 
306 aa  62  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0817  hypothetical protein  25.91 
 
 
287 aa  62  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1994  hypothetical protein  28.02 
 
 
290 aa  61.6  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000553659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3006  protein of unknown function DUF161  28.06 
 
 
286 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000192497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1588  Protein of unknown function DUF2179  25.68 
 
 
289 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  0.342251 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0885  protein of unknown function DUF161  25.27 
 
 
280 aa  59.3  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000434482  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1475  protein of unknown function DUF161  23.21 
 
 
286 aa  59.3  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  27.51 
 
 
290 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  26.6 
 
 
283 aa  58.9  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  27.17 
 
 
287 aa  58.5  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  25.24 
 
 
298 aa  58.5  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1039  hypothetical protein  24.58 
 
 
315 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  20.42 
 
 
283 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  21.5 
 
 
296 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0967  hypothetical protein  27.78 
 
 
281 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0743  hypothetical protein  27.4 
 
 
279 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108912  hitchhiker  0.0000688961 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  25.63 
 
 
278 aa  55.8  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3191  Protein of unknown function DUF2179  28.18 
 
 
287 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  27.92 
 
 
283 aa  55.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  20.73 
 
 
296 aa  55.1  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2920  protein of unknown function DUF161  31.19 
 
 
303 aa  55.1  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000232125  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  23.59 
 
 
323 aa  54.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3231  hypothetical protein  24.89 
 
 
281 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.581359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3033  hypothetical protein  26.7 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.238411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3014  hypothetical protein  26.7 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.098054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2954  hypothetical protein  26.8 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3266  hypothetical protein  26.7 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3259  hypothetical protein  26.7 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2074  hypothetical protein  24.89 
 
 
281 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3612  hypothetical protein  26.29 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3254  hypothetical protein  26.8 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  27.66 
 
 
302 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>