222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1070 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1070  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  665    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1475  protein of unknown function DUF161  38.75 
 
 
286 aa  203  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0930  hypothetical protein  35.04 
 
 
281 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0214742  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0771  hypothetical protein  32.97 
 
 
283 aa  159  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0290  hypothetical protein  33.7 
 
 
285 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000120699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0295  hypothetical protein  32.97 
 
 
285 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0748  hypothetical protein  32.97 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0644757  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0228  yitT family protein  31.41 
 
 
278 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0210  yitT family protein  31.41 
 
 
278 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0196  hypothetical protein  31.41 
 
 
278 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.851419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0200  hypothetical protein  31.41 
 
 
278 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0218  yitT family protein  31.41 
 
 
278 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5091  yitT family protein  30.69 
 
 
278 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0235  yitT family protein  30.69 
 
 
278 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0234  yitT family protein  30.69 
 
 
278 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0253  yitT family protein  30.69 
 
 
278 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0196  hypothetical protein  30.32 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  32.56 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0203  hypothetical protein  30.69 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  27.78 
 
 
311 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3006  protein of unknown function DUF161  29.14 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000192497  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  28.52 
 
 
290 aa  139  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  30.71 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  28.06 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0967  hypothetical protein  32.73 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3191  Protein of unknown function DUF2179  29.29 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  29.96 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  29.93 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  31.52 
 
 
286 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  27.21 
 
 
287 aa  129  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  30.51 
 
 
289 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3033  hypothetical protein  28.16 
 
 
279 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.238411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3259  hypothetical protein  28.16 
 
 
279 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3014  hypothetical protein  28.16 
 
 
279 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.098054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3266  hypothetical protein  28.16 
 
 
279 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3284  hypothetical protein  28.06 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.565823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3254  hypothetical protein  28.16 
 
 
279 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2954  hypothetical protein  28.16 
 
 
279 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  28.22 
 
 
288 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0748  hypothetical protein  26.37 
 
 
295 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.796789  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1994  hypothetical protein  31.05 
 
 
290 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000553659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  29.93 
 
 
293 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0780  hypothetical protein  29.53 
 
 
293 aa  124  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0139128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  32.26 
 
 
283 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  29.2 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  28.73 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  29.2 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  29.56 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  29.56 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  29.88 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  29.2 
 
 
293 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  29.2 
 
 
293 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2979  hypothetical protein  27.34 
 
 
279 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.034636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  29.2 
 
 
293 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  29.2 
 
 
293 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  29.2 
 
 
293 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  28.47 
 
 
304 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1996  hypothetical protein  27.44 
 
 
279 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  29.56 
 
 
290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1380  hypothetical protein  28 
 
 
285 aa  119  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000107649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0305  hypothetical protein  26.84 
 
 
277 aa  119  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  29.2 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3566  protein of unknown function DUF161  28.67 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332576  normal  0.685125 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  27.9 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  30.36 
 
 
285 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  29.96 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0885  protein of unknown function DUF161  28.41 
 
 
280 aa  116  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000434482  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  27.74 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2616  protein of unknown function DUF161  27.14 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000720176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1419  hypothetical protein  33.04 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0760  hypothetical protein  27.76 
 
 
287 aa  113  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  27.3 
 
 
299 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  26.64 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0536  protein of unknown function DUF161  28.35 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0907  hypothetical protein  29.37 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00009581 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0669  hypothetical protein  24.91 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.866307  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0684  hypothetical protein  24.91 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2703  hypothetical protein  29.24 
 
 
301 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000135804  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  26.62 
 
 
306 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  27.34 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2920  protein of unknown function DUF161  28.28 
 
 
303 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000232125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2046  protein of unknown function DUF161  29.33 
 
 
301 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.302347  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2546  hypothetical protein  29.67 
 
 
294 aa  106  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000203917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  26.88 
 
 
296 aa  106  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  27.44 
 
 
290 aa  105  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2215  protein of unknown function DUF161  25.69 
 
 
294 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00368135  hitchhiker  0.000374105 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2223  hypothetical protein  29.32 
 
 
294 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000101287  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  29.63 
 
 
311 aa  103  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2224  hypothetical protein  28 
 
 
291 aa  103  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00399664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  27.64 
 
 
302 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2267  protein of unknown function DUF161  25.61 
 
 
299 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155206  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0817  hypothetical protein  28.09 
 
 
287 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0080  hypothetical protein  26.69 
 
 
297 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5168  hypothetical protein  26.69 
 
 
297 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3612  hypothetical protein  28.96 
 
 
290 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2836  protein of unknown function DUF161  28.76 
 
 
281 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3010  hypothetical protein  25.97 
 
 
292 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0879703  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  27.97 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  26.69 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  26.69 
 
 
297 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>