83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1226 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1226  methyltransferase  100 
 
 
296 aa  615  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3250  hypothetical protein  37.14 
 
 
304 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2941  hypothetical protein  36.31 
 
 
306 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.324225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3264  hypothetical protein  35.14 
 
 
306 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3019  hypothetical protein  36.42 
 
 
306 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2007  hypothetical protein  35.14 
 
 
306 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000735866  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3270  methyltransferase, putative, family  35.24 
 
 
304 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3252  hypothetical protein  36.42 
 
 
306 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000435878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3004  hypothetical protein  35.44 
 
 
306 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1707  hypothetical protein  32.48 
 
 
304 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.410667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  33.55 
 
 
304 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0827  putative methyltransferase  30 
 
 
284 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1717  methyltransferase  28.3 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.203121  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  25.72 
 
 
648 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  24.54 
 
 
639 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  31.8 
 
 
311 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  27.6 
 
 
276 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
604 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
604 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
630 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
630 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
604 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3240  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
604 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
659 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  30.05 
 
 
297 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  27.11 
 
 
307 aa  86.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  29.58 
 
 
276 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2212  putative methyltransferase  24.05 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  24.55 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  24.9 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  27.22 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0188  putative methyltransferase  21.91 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  30.15 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  29.63 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  26.9 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  25.73 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  26.46 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  27.22 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  27.22 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  28.34 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  27.74 
 
 
287 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  27.97 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  28.68 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  28.68 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  31.25 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  28.68 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  28.99 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  28.57 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  30.7 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  30.7 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  27.89 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  28.26 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3239  hypothetical protein  34.87 
 
 
143 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  23.87 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  24.76 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0209  hypothetical protein  24.76 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  24.76 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  23.44 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  24.76 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1806  hypothetical protein  24.76 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  24.76 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  27.21 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  23.89 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  24.88 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2390  putative methyltransferase  23.56 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206641  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12764  hypothetical protein  25.38 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.454721 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0164  putative methyltransferase  26.17 
 
 
464 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2218  hypothetical protein  21.4 
 
 
351 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1545  putative methyltransferase  21.29 
 
 
307 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6572  methyltransferase  25.22 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  28.46 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  25.83 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4761  methyltransferase  24.22 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.991548  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  21.52 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  21 
 
 
307 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  25.19 
 
 
314 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  23.14 
 
 
798 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  23.77 
 
 
298 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  24.76 
 
 
291 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  24.79 
 
 
309 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>