110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0188 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0188  putative methyltransferase  100 
 
 
292 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0827  putative methyltransferase  25.42 
 
 
284 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  34.6 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  34.74 
 
 
286 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  34.74 
 
 
286 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  32.88 
 
 
285 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  33.79 
 
 
287 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  33.79 
 
 
287 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
648 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  37.04 
 
 
285 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  32.29 
 
 
287 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  32.54 
 
 
285 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
639 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
604 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
659 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
604 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
630 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
604 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
630 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
604 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2212  putative methyltransferase  29.67 
 
 
285 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  32.36 
 
 
285 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  30.48 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1717  methyltransferase  37.14 
 
 
280 aa  99.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.203121  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  31.64 
 
 
276 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  30.53 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1707  hypothetical protein  24.83 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.410667  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  25.5 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  31.14 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  30.88 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  32.73 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3270  methyltransferase, putative, family  24.58 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716508  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  31.62 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3264  hypothetical protein  24.33 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  30.53 
 
 
289 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2007  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000735866  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  32.37 
 
 
286 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
286 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  32.37 
 
 
286 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0209  hypothetical protein  32.37 
 
 
286 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  32.37 
 
 
286 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1806  hypothetical protein  32.37 
 
 
286 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  32.37 
 
 
286 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2941  hypothetical protein  23.33 
 
 
306 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.324225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3004  hypothetical protein  23.67 
 
 
306 aa  92.4  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3250  hypothetical protein  22.88 
 
 
304 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3019  hypothetical protein  23 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3252  hypothetical protein  23 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000435878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  35 
 
 
276 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  25.77 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1226  methyltransferase  21.91 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  29.3 
 
 
295 aa  82  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  22.82 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  24.56 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  27.08 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  22.9 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  27.36 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  24.18 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  25.24 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  23.53 
 
 
209 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  25.96 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  25.55 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1545  putative methyltransferase  36.05 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  40 
 
 
798 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3240  hypothetical protein  25.49 
 
 
150 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  32.75 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  38.64 
 
 
308 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  40.46 
 
 
278 aa  55.8  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  38.64 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  38.64 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  28.57 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12764  hypothetical protein  36.03 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.454721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2390  putative methyltransferase  30.11 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206641  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2218  hypothetical protein  35.43 
 
 
351 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  34.81 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  34.62 
 
 
348 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  28.11 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  28.11 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  36.64 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  34.39 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5024  putative methyltransferase  33.02 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  38.93 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  38.93 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0358  putative methyltransferase  38.93 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10146  hypothetical protein  32.45 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  34.34 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203136  hitchhiker  0.000000140012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0933  putative methyltransferase  38.85 
 
 
304 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0078  putative methyltransferase  36.97 
 
 
312 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809042  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  31.72 
 
 
304 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  31.72 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  31.72 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7735  protein of unknown function Mtu_121  36.23 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0088  hypothetical protein  35.59 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0097  putative methyltransferase  35.59 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0973562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0910  putative methyltransferase  34.03 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  35.21 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3841  methyltransferase  31.07 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  32.19 
 
 
308 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>