127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0022 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  84.27 
 
 
289 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  76.22 
 
 
286 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  77.89 
 
 
292 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  76.92 
 
 
285 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  77.54 
 
 
293 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  75.52 
 
 
286 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  75.52 
 
 
286 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  75.09 
 
 
287 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  74.74 
 
 
287 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  74.74 
 
 
287 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  68.18 
 
 
285 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  66.2 
 
 
286 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  64.69 
 
 
285 aa  367  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  64.81 
 
 
286 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  64.81 
 
 
286 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  64.81 
 
 
286 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0209  hypothetical protein  64.81 
 
 
286 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  64.81 
 
 
286 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1806  hypothetical protein  65.16 
 
 
286 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  64.81 
 
 
286 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  65.38 
 
 
285 aa  349  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  64.34 
 
 
285 aa  341  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  63.99 
 
 
285 aa  340  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
604 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
604 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
604 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
630 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
630 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
604 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
659 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
648 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
639 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  40.56 
 
 
292 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2212  putative methyltransferase  35.25 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2941  hypothetical protein  28.22 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.324225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  34.15 
 
 
311 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0827  putative methyltransferase  29.76 
 
 
284 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3250  hypothetical protein  28.18 
 
 
304 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3264  hypothetical protein  28.87 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3019  hypothetical protein  28.08 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3252  hypothetical protein  28.08 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000435878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3004  hypothetical protein  29.11 
 
 
306 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1717  methyltransferase  35.16 
 
 
280 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.203121  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  39.15 
 
 
276 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1707  hypothetical protein  28.72 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.410667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  37.91 
 
 
276 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3270  methyltransferase, putative, family  28.08 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2007  hypothetical protein  32.38 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000735866  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  34.2 
 
 
297 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  31.75 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0188  putative methyltransferase  31.14 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  28.25 
 
 
311 aa  85.9  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  34.93 
 
 
298 aa  85.5  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  30.88 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  31.34 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  28.57 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  38.82 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  38.82 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  28.43 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  36.84 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  38.82 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  33.8 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  30.39 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  34.29 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  26.6 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1226  methyltransferase  28.26 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  23.33 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  28.63 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  35.76 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  31.92 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203136  hitchhiker  0.000000140012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  33.12 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  34.4 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3240  hypothetical protein  27.66 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  29.55 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  35.76 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  35.11 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  33.03 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  33.03 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1346  putative methyltransferase  34.88 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0358  putative methyltransferase  33.03 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  36.23 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1573  protein of unknown function Mtu_121  34.27 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894053  normal  0.0567385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0580  hypothetical protein  37.27 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832218  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  35.51 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  32.52 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0592  putative methyltransferase  37.27 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0567855 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  35.51 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0104  putative methyltransferase  41.03 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0570  putative methyltransferase  37.27 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  32.32 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  32.32 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  32.32 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  34.62 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  38.64 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  35.61 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4761  methyltransferase  36 
 
 
313 aa  58.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.991548  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10912  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12764  hypothetical protein  31.93 
 
 
296 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.454721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>