128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6184 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  100 
 
 
289 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  84.27 
 
 
286 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  79.02 
 
 
286 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  78.6 
 
 
292 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  80.29 
 
 
293 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  77.62 
 
 
286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  77.62 
 
 
286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  79.02 
 
 
285 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  76.14 
 
 
287 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  75.79 
 
 
287 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  75.79 
 
 
287 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  70.28 
 
 
285 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  67.94 
 
 
286 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  65.73 
 
 
285 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  65.85 
 
 
286 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  65.85 
 
 
286 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  65.85 
 
 
286 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0209  hypothetical protein  65.85 
 
 
286 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  65.85 
 
 
286 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1806  hypothetical protein  66.2 
 
 
286 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  65.85 
 
 
286 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  65.03 
 
 
285 aa  348  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  63.99 
 
 
285 aa  341  9e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  65.11 
 
 
285 aa  340  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
630 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
604 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
630 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
604 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
604 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
659 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
604 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
648 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  37.54 
 
 
639 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  41.6 
 
 
292 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2212  putative methyltransferase  36.02 
 
 
285 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  33.96 
 
 
311 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1717  methyltransferase  35.94 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.203121  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0827  putative methyltransferase  30.4 
 
 
284 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2941  hypothetical protein  27.97 
 
 
306 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.324225  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  37.91 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3250  hypothetical protein  27.93 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  37.91 
 
 
276 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3019  hypothetical protein  27.59 
 
 
306 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3252  hypothetical protein  27.59 
 
 
306 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000435878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3264  hypothetical protein  27.93 
 
 
306 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3004  hypothetical protein  28.62 
 
 
306 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3270  methyltransferase, putative, family  27.84 
 
 
304 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1707  hypothetical protein  28.33 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.410667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2007  hypothetical protein  31.88 
 
 
306 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000735866  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  30.84 
 
 
295 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  34.47 
 
 
297 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0188  putative methyltransferase  30.53 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  31.71 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  27.57 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  35.62 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  32.69 
 
 
307 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  30 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  25.62 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  35.12 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  26.09 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  36.17 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  27.94 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  36.75 
 
 
209 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  37.13 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  37.13 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  37.13 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  36.36 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  28.24 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  26.03 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1226  methyltransferase  27.89 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  30.24 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  34.53 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12764  hypothetical protein  29.61 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.454721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  34.57 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  31.03 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203136  hitchhiker  0.000000140012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1573  protein of unknown function Mtu_121  30.91 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894053  normal  0.0567385 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3240  hypothetical protein  27.66 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  29.96 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  34.48 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0933  putative methyltransferase  32.48 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  34.29 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  32.61 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  34.44 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  35 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0580  hypothetical protein  33.58 
 
 
242 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0592  putative methyltransferase  33.58 
 
 
249 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0567855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0570  putative methyltransferase  33.58 
 
 
249 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  30.51 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  32.42 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  29.57 
 
 
304 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  29.57 
 
 
304 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  35.51 
 
 
297 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0104  putative methyltransferase  40.17 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  34.78 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  34.78 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1346  putative methyltransferase  34.71 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4761  methyltransferase  35.1 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.991548  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2218  hypothetical protein  41.86 
 
 
351 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  32.37 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  32.37 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>