54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0733 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0733  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
107 aa  219  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515605 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1919  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  75.7 
 
 
107 aa  180  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1390  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  71.96 
 
 
111 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0829  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  72.9 
 
 
109 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000223685  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36390  PemK-like protein  56.07 
 
 
107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4226  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  56.6 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371051  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3335  hypothetical protein  56.07 
 
 
107 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  54.21 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0793  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  54.21 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109147  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0310  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  54.21 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0395146  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3665  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  55.24 
 
 
110 aa  124  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0264223  hitchhiker  0.0000119416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0976  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  53.27 
 
 
109 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1422  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50.47 
 
 
108 aa  120  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4051899999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1011  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  56.6 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1792  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.34 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0449033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4772  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.08 
 
 
97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.758226  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4316  PemK-like protein  49.06 
 
 
107 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.649959  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1345  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  68.49 
 
 
77 aa  110  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.17 
 
 
107 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1052  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.67 
 
 
119 aa  96.7  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3386  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.67 
 
 
119 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0759574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1043  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.67 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0821  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.52 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0586  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.04 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354124  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0376  hypothetical protein  36.11 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1113  pemK family protein  42.31 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2930  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.61 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.451629  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.32 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.46 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.71 
 
 
117 aa  52  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3202  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.73 
 
 
119 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.68 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.79 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.79 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  25.89 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5889  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.93 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000397508 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  25.89 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.31 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.45 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0359  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.19 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1879  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.89 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2528  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.89 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.89 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.52 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000297621  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  24.76 
 
 
110 aa  42.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2603  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.83 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.996132  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4535  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.96 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0469599  normal  0.805558 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1640  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  26.36 
 
 
118 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0998854  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1737  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.27 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  23.42 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11123  hypothetical protein  31.52 
 
 
103 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>