67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1737 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1737  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 115 aa  238  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0832  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.29 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.737175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2435  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.71 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.250291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  25.93 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0821  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.95 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.58 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.03 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.13 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5889  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.19 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000397508 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4535  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.52 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0469599  normal  0.805558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1011  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.61 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.19 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.19 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.02 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.16 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  30.3 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3386  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.23 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0759574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.21 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1071  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.09 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.28 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2312  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  23.36 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1052  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.23 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1390  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.95 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  26.92 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  40.91 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.46 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.41 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.92 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3202  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.43 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.36 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  32.04 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0676  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.36 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.36 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.45 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3335  hypothetical protein  30.43 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  23.6 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.42 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.42 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  23.81 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  31.07 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.72 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.36 
 
 		 123 aa  42  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2422  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.32 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0162506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  35.06 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.03 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.88 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1319  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  24.11 
 
 		 117 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00212253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2335  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  24.55 
 
 		 119 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40 
 
 		 107 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.23 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2049  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.21 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  27.27 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0733  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.27 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12023  hypothetical protein  26.13 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1185  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  23.81 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.62 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5455  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.51 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.24 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1919  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.9 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0352  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.26 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  25.47 
 
 		 110 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  23.08 
 
 		 114 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.43 
 
 		 116 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1831  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.43 
 
 		 118 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.47 
 
 		 106 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>