31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4470 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 107 aa  213  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1011  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  56.07 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4316  PemK-like protein  53.27 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.649959  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0829  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  49.51 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000223685  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1919  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.89 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0733  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.17 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36390  PemK-like protein  49.06 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1390  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.89 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3335  hypothetical protein  42.45 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4226  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.28 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371051  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3665  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.63 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0264223  hitchhiker  0.0000119416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4772  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50.52 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.758226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0976  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.4 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0310  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.17 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0395146  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0793  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.17 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.17 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1792  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.17 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449033 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1422  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.34 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4051899999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3386  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.19 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0759574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1052  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.81 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1043  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.25 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0821  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.32 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0586  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.5 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0376  hypothetical protein  35.51 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2930  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.96 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.451629  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1345  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.61 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1113  pemK family protein  36.26 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1737  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.21 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.14 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0832  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.76 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.737175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.09 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>