47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3386 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3386  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 119 aa  244  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0759574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1052  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  89.08 
 
 		 119 aa  225  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1043  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  74.56 
 
 		 118 aa  191  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0821  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  68.75 
 
 		 114 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304707 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1113  pemK family protein  76.14 
 
 		 94 aa  144  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1792  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2930  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.18 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.451629  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1390  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.14 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1919  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.67 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0733  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.67 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515605 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4226  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.25 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371051  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.59 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0310  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.59 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0395146  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0793  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.59 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36390  PemK-like protein  41.67 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3665  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.99 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0264223  hitchhiker  0.0000119416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1422  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.81 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4051899999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3335  hypothetical protein  38.32 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0976  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.32 
 
 		 109 aa  91.3  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0829  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.81 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000223685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1011  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.32 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4316  PemK-like protein  41.67 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.649959  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.19 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4772  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.96 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.758226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0586  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.53 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0376  hypothetical protein  34.86 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1345  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.79 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.57 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  25.86 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0832  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.95 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.737175  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1737  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.23 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2312  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.03 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.2 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.35 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  24.14 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.66 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1380  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.12 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2564  PemK family protein  24.55 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.17 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.930315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.17 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.43 
 
 		 116 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0359  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.72 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  24.14 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.09 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.09 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.88 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1879  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.55 
 
 		 115 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>